More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3218 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  100 
 
 		 329 aa  674    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  54.76 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  51.67 
 
 		 308 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  50.33 
 
 		 314 aa  281  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  50.5 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  50.5 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  50.5 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  51.14 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  50.5 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  50.82 
 
 		 314 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  50 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  50.33 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  49.34 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  48.73 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  50.17 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  50.17 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  50.17 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  50 
 
 		 308 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  49.33 
 
 		 305 aa  269  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  46.75 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  48.83 
 
 		 312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  50.98 
 
 		 314 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  48.08 
 
 		 322 aa  265  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  46.38 
 
 		 309 aa  261  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  47.99 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  51.06 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  43.9 
 
 		 296 aa  228  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  46.18 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  36.92 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  35.89 
 
 		 277 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  33.83 
 
 		 246 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  30.47 
 
 		 241 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  32.5 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  29.14 
 
 		 257 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  30.27 
 
 		 275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.43 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  30.14 
 
 		 281 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  32.1 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  29 
 
 		 268 aa  126  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  30.34 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  28.03 
 
 		 275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  29.85 
 
 		 249 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  30.69 
 
 		 305 aa  119  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  29.15 
 
 		 267 aa  119  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  27.76 
 
 		 261 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  28.94 
 
 		 262 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  29.89 
 
 		 256 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  28.94 
 
 		 262 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  32.84 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  30.34 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  28.42 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  28.32 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  27.96 
 
 		 266 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  31.14 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  28.94 
 
 		 262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  30.32 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  29.74 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  28.09 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  28.57 
 
 		 262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  32.86 
 
 		 305 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  28.57 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  28.89 
 
 		 265 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  30.34 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  28.42 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  40.48 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  27.14 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  29.96 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  29.93 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  27.66 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  29.71 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  29.71 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  26.26 
 
 		 266 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  29.59 
 
 		 253 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  29.82 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  30.26 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1716  chemotaxis protein PomB  36.23 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.81071  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  28.14 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  26.62 
 
 		 267 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  30.55 
 
 		 251 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  29.09 
 
 		 285 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  29.09 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  28.68 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  29.93 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  30.22 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  30.86 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  27.96 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  40.12 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  29.09 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  42.03 
 
 		 460 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  28.83 
 
 		 295 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1946  OmpA/MotB domain-containing protein  31.74 
 
 		 257 aa  99.8  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0980886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  40.46 
 
 		 225 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  25.35 
 
 		 244 aa  96.3  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  27.64 
 
 		 295 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  25.84 
 
 		 295 aa  96.3  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  30.26 
 
 		 273 aa  95.9  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  28.25 
 
 		 251 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  27.51 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>