More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01429 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  100 
 
 
309 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  80.39 
 
 
305 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  66.56 
 
 
318 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  61.42 
 
 
325 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  63.9 
 
 
314 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  61.99 
 
 
322 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  64.29 
 
 
308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  66.1 
 
 
308 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  68.04 
 
 
314 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  62.66 
 
 
310 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  62.66 
 
 
310 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  62.66 
 
 
310 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  62.66 
 
 
310 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  63 
 
 
308 aa  388  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  63.67 
 
 
306 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  63.67 
 
 
306 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  63.67 
 
 
306 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  58.39 
 
 
322 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  58.28 
 
 
314 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  59.48 
 
 
315 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  57.93 
 
 
318 aa  367  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  61.69 
 
 
312 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  59.09 
 
 
309 aa  363  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  46.13 
 
 
330 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  47.81 
 
 
329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  42.14 
 
 
305 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  43.56 
 
 
280 aa  202  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  40.21 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  31.29 
 
 
275 aa  132  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  32.63 
 
 
277 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  28.22 
 
 
246 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  29.18 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  36.47 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  28.18 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  29.08 
 
 
266 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  27.24 
 
 
245 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  26.71 
 
 
271 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  27.92 
 
 
265 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  27.21 
 
 
257 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  26.57 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  43.07 
 
 
442 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  27.8 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  26.95 
 
 
263 aa  96.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  25.76 
 
 
267 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  28.98 
 
 
305 aa  95.5  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  25.99 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  32.93 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  27.96 
 
 
248 aa  94.7  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  26.55 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  27.21 
 
 
295 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  35.17 
 
 
415 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  28.42 
 
 
323 aa  93.2  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  27.4 
 
 
305 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  24.39 
 
 
267 aa  92.8  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  26.07 
 
 
262 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  26.07 
 
 
262 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  25.81 
 
 
268 aa  92.4  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  26.88 
 
 
254 aa  92.4  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1946  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0980886  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  26.64 
 
 
275 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  26.15 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  27.87 
 
 
276 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  45.12 
 
 
367 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  28.67 
 
 
241 aa  89.4  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  26.15 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  25.81 
 
 
253 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  26.15 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  24.91 
 
 
266 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  36.69 
 
 
449 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  25.71 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  25.71 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  25.71 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  25.71 
 
 
261 aa  87  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  25.52 
 
 
271 aa  86.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  25.18 
 
 
257 aa  85.9  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3511  putative chemotaxis protein MotB  28.22 
 
 
276 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  25.53 
 
 
269 aa  85.9  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  30.3 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  35.97 
 
 
449 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  25.36 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  25.69 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  25.99 
 
 
263 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  33.13 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1237  OmpA/MotB  26.6 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258144  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  26.16 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  27.95 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2101  OmpA/MotB  28.28 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.61631 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  32.05 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  26.52 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2079  OmpA/MotB  28.96 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299736  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  24.74 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  42.68 
 
 
366 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  42.68 
 
 
366 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  27.96 
 
 
259 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  37.23 
 
 
452 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  25.09 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  33.54 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4831  OmpA/MotB domain-containing protein  26.62 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.540375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  31.33 
 
 
443 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5298  OmpA/MotB domain protein  26.62 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>