More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1530 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  100 
 
 		 308 aa  629  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  97.06 
 
 		 306 aa  586  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  97.06 
 
 		 306 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  97.06 
 
 		 306 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  93.4 
 
 		 310 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  93.4 
 
 		 310 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  93.4 
 
 		 310 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  92.43 
 
 		 308 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  93.4 
 
 		 310 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  81.45 
 
 		 325 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  79.25 
 
 		 322 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  81.23 
 
 		 314 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  83.5 
 
 		 312 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  78.83 
 
 		 318 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  80 
 
 		 308 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  79.18 
 
 		 322 aa  484  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  65.67 
 
 		 305 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  63 
 
 		 309 aa  393  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  63.26 
 
 		 314 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  58.88 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  57.98 
 
 		 315 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  57 
 
 		 314 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  56.07 
 
 		 318 aa  358  9e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  50.33 
 
 		 329 aa  255  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  45.55 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  46.74 
 
 		 280 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  43 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  41.89 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  30.1 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  34.02 
 
 		 266 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  35.82 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  30.74 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  27.82 
 
 		 266 aa  122  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  27.65 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  28.62 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  29.27 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  28.67 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  27.87 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  34.57 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  28.82 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  27.21 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  28.29 
 
 		 259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  29.03 
 
 		 257 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  42.11 
 
 		 437 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  27.7 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  41.3 
 
 		 438 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  41.3 
 
 		 438 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  41.3 
 
 		 438 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  41.3 
 
 		 438 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  41.3 
 
 		 438 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  41.3 
 
 		 438 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  28.42 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  30.14 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  41.3 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  25.85 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.34 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  26.22 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  39.13 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  36.09 
 
 		 256 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  25.5 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  40.15 
 
 		 440 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  26.41 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  26.41 
 
 		 262 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  32.22 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  26.51 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  25.33 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  27.56 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  27.87 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  38.41 
 
 		 460 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  26.33 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  28.18 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  31.74 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  25.44 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  25.68 
 
 		 253 aa  97.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  26.41 
 
 		 262 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  35.1 
 
 		 452 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  27.27 
 
 		 285 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  24.39 
 
 		 261 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  26.22 
 
 		 295 aa  95.5  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  26.06 
 
 		 262 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  26.06 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  26.57 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  26.92 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  26.15 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  26.15 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  27.4 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  35.86 
 
 		 238 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  26.57 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  36.23 
 
 		 442 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  27.92 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  25.09 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  26.07 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  23.1 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  36.84 
 
 		 406 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  36.11 
 
 		 494 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  30.25 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  27.82 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  25.26 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  31.16 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>