More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2432 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  100 
 
 
312 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  85.39 
 
 
310 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  85.39 
 
 
310 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  85.39 
 
 
310 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  85.39 
 
 
310 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  85.48 
 
 
308 aa  541  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  85.2 
 
 
306 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  85.2 
 
 
306 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  85.2 
 
 
306 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  83.5 
 
 
308 aa  532  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  79.75 
 
 
325 aa  530  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  84.47 
 
 
314 aa  526  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  80.76 
 
 
322 aa  521  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  82.45 
 
 
318 aa  507  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  79.74 
 
 
308 aa  501  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  77.19 
 
 
322 aa  481  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  64.33 
 
 
305 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  61.97 
 
 
309 aa  401  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  62.01 
 
 
309 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  60.26 
 
 
315 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  60.65 
 
 
314 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  63.99 
 
 
314 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  59.42 
 
 
318 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  50.33 
 
 
329 aa  256  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  44.63 
 
 
330 aa  241  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  40.47 
 
 
296 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  40.54 
 
 
305 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  44.41 
 
 
280 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  36.49 
 
 
277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  31.1 
 
 
246 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  30.62 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  33.79 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  27.46 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  30.56 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  29.17 
 
 
275 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  30.39 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  27.65 
 
 
238 aa  116  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  27.89 
 
 
275 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  28.28 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  28.11 
 
 
257 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  29.23 
 
 
241 aa  113  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  34.93 
 
 
271 aa  112  9e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  26.33 
 
 
245 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
236 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  28.72 
 
 
259 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  26.8 
 
 
266 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  25.18 
 
 
257 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  25.83 
 
 
267 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  28.06 
 
 
288 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  28.33 
 
 
338 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  29.14 
 
 
305 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  26.8 
 
 
254 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  25.9 
 
 
263 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  25.52 
 
 
295 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  24.82 
 
 
271 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  26.8 
 
 
263 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  25.94 
 
 
253 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  27.05 
 
 
265 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  39.85 
 
 
437 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  39.13 
 
 
438 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  24.75 
 
 
258 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  39.13 
 
 
438 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  39.13 
 
 
438 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  39.13 
 
 
438 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  39.13 
 
 
438 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  39.13 
 
 
438 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  39.13 
 
 
438 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  31.86 
 
 
275 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 
280 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  27 
 
 
257 aa  99.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  36.96 
 
 
430 aa  99.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  26.76 
 
 
271 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  26.67 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  25.61 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  25.94 
 
 
248 aa  96.7  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  29.08 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  26.69 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  36.23 
 
 
460 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  23.39 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  26.69 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  29.08 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  37.23 
 
 
440 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  27.3 
 
 
285 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  26.21 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  28.72 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  29.33 
 
 
276 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  36.81 
 
 
268 aa  92.8  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  31.84 
 
 
248 aa  92.8  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  27.76 
 
 
269 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  26.52 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2101  OmpA/MotB  27.8 
 
 
275 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.61631 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  25.62 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  26.64 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  33.11 
 
 
452 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  28.39 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  29.08 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1237  OmpA/MotB  29 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258144  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  33.78 
 
 
256 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  39.1 
 
 
413 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  24.49 
 
 
271 aa  89.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>