More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1323 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  100 
 
 		 305 aa  619  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  80.39 
 
 		 309 aa  505  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  66.03 
 
 		 322 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  67.11 
 
 		 314 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  68.33 
 
 		 308 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  68.14 
 
 		 318 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  63.49 
 
 		 325 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  68.44 
 
 		 308 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  66.33 
 
 		 310 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  66.33 
 
 		 310 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  66.33 
 
 		 310 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  66.33 
 
 		 310 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  66.33 
 
 		 306 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  66.33 
 
 		 306 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  66.33 
 
 		 306 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  65.67 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  64.86 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  67.63 
 
 		 314 aa  391  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  64.33 
 
 		 312 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  57.05 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  56.73 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  58.69 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  59.16 
 
 		 318 aa  362  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  48.31 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  49.33 
 
 		 329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  43.69 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  40.59 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  40.2 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  29.05 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  30.47 
 
 		 266 aa  122  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  29.07 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  27.5 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  27.44 
 
 		 245 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  27.76 
 
 		 266 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  27.15 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  27.02 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  25.93 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  25.78 
 
 		 238 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  25.95 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  27.62 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  26.52 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  25.26 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  28.37 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  25.61 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  25.61 
 
 		 267 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  29.54 
 
 		 323 aa  99  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  26.57 
 
 		 253 aa  99  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  29.75 
 
 		 248 aa  98.6  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  28.32 
 
 		 342 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  27.64 
 
 		 263 aa  96.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  24.56 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  30.43 
 
 		 276 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  24.55 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  26.07 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 257 aa  93.2  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  26.22 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  24.39 
 
 		 259 aa  92.8  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  25.57 
 
 		 338 aa  92.4  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  26.09 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  24.64 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  25.09 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  23.63 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  24.64 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  46.34 
 
 		 367 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2101  OmpA/MotB  29.77 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.61631 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  32 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  30.27 
 
 		 274 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  29.58 
 
 		 236 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1237  OmpA/MotB  30.36 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  35.03 
 
 		 219 aa  89  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  38.41 
 
 		 442 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3511  putative chemotaxis protein MotB  29.79 
 
 		 276 aa  89  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 		 241 aa  89  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  45.28 
 
 		 223 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 223 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  46.23 
 
 		 228 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  30.49 
 
 		 225 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2079  OmpA/MotB  29.14 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  46.23 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  24.82 
 
 		 262 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3363  OmpA/MotB  29.41 
 
 		 273 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0104995 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  22.46 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  25.96 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  24.82 
 
 		 262 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 223 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  31.29 
 
 		 225 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  31.29 
 
 		 225 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  31.29 
 
 		 225 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  30.61 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  30.61 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  30.61 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  25.63 
 
 		 251 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  30.61 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  30.61 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  30.61 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  25.26 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  26.16 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>