More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3325 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  100 
 
 		 325 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  83.69 
 
 		 322 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  85.85 
 
 		 314 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  86.88 
 
 		 322 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  81.62 
 
 		 310 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  81.62 
 
 		 310 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  81.62 
 
 		 310 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  81.62 
 
 		 310 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  81.33 
 
 		 308 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  80.62 
 
 		 306 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  80.62 
 
 		 306 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  80.62 
 
 		 306 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  80.19 
 
 		 308 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  76.1 
 
 		 318 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  79.44 
 
 		 312 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  76.88 
 
 		 308 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  63.49 
 
 		 305 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  61.42 
 
 		 309 aa  408  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  63.84 
 
 		 314 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  56.62 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  57.54 
 
 		 309 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  56.88 
 
 		 315 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  55.76 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  45.17 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  48.73 
 
 		 329 aa  255  8e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  40.92 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  40 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  42.05 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  31.15 
 
 		 275 aa  142  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  27.84 
 
 		 366 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 		 366 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  28.91 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  25.96 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  28.71 
 
 		 241 aa  106  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  27.91 
 
 		 323 aa  105  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  27.8 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  42.62 
 
 		 266 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  34.03 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  27.61 
 
 		 265 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  25.08 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  41.3 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  41.3 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  41.3 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  42.11 
 
 		 437 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  41.3 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  41.3 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  41.3 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  39.86 
 
 		 460 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  41.3 
 
 		 438 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 		 236 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  34.13 
 
 		 275 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  34.16 
 
 		 225 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  38.41 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  38.41 
 
 		 442 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  22.79 
 
 		 271 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  40.15 
 
 		 440 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  25.48 
 
 		 254 aa  96.7  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  24.58 
 
 		 267 aa  96.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  33.75 
 
 		 227 aa  96.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  33.54 
 
 		 225 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  24.69 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  33.54 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  33.54 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  26.87 
 
 		 288 aa  95.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  36.13 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  38.46 
 
 		 460 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  32.92 
 
 		 225 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  26.03 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.19 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  38.41 
 
 		 452 aa  94.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  30.16 
 
 		 276 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  32.92 
 
 		 225 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  32.92 
 
 		 225 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  32.92 
 
 		 225 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  32.92 
 
 		 225 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  32.92 
 
 		 225 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  32.95 
 
 		 256 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  23.42 
 
 		 295 aa  92.4  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  27.46 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  29.24 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  35.53 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  35.29 
 
 		 443 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  24.58 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  24.58 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  32.91 
 
 		 275 aa  90.9  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  30.79 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  26.97 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  33.55 
 
 		 248 aa  89.7  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  33.12 
 
 		 257 aa  89.4  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  25.59 
 
 		 261 aa  89.4  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1237  OmpA/MotB  30.16 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  34.46 
 
 		 283 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  29.9 
 
 		 261 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 		 272 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  24.52 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  36.5 
 
 		 430 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2101  OmpA/MotB  28.08 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.61631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>