More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2336 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
295 aa  598  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2016  OmpA/MotB domain protein  38.38 
 
 
305 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  39.07 
 
 
295 aa  196  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  38.77 
 
 
342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0748  OmpA/MotB domain-containing protein  39.52 
 
 
302 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  40.07 
 
 
290 aa  186  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0967  OmpA/MotB domain protein  45.42 
 
 
313 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  36.68 
 
 
266 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 
275 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 
261 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  33.58 
 
 
249 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 
268 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  29.93 
 
 
271 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  36.8 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  33.7 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  30.66 
 
 
257 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  36.92 
 
 
288 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  32.58 
 
 
257 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  31.52 
 
 
256 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  31.62 
 
 
275 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  31.77 
 
 
254 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  30.6 
 
 
253 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  29.35 
 
 
245 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  33.22 
 
 
305 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  31.91 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 
271 aa  136  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  30.04 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  29.35 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  31.43 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  31.39 
 
 
285 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  32.71 
 
 
262 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  32.71 
 
 
262 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  30.27 
 
 
269 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 
238 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  28.47 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  30.86 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  31.97 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  31.94 
 
 
244 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  30.91 
 
 
269 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  30.66 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  30.66 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  31.02 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  31.6 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  31.6 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  30.32 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  31.32 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  31.97 
 
 
262 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  31.97 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  28.21 
 
 
296 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  30.58 
 
 
259 aa  125  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  28.21 
 
 
296 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  31.97 
 
 
262 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  30.04 
 
 
296 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  30.04 
 
 
266 aa  122  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  29.56 
 
 
258 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0148  OmpA/MotB domain protein  36.07 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  26.36 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  30.86 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  27.76 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  29.97 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  26.16 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  29.75 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  30.99 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  26.94 
 
 
295 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  27.31 
 
 
295 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  30.62 
 
 
241 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.36 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  30.11 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  27.27 
 
 
260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  27.37 
 
 
273 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  45.45 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  42.96 
 
 
242 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  27.02 
 
 
273 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  31.27 
 
 
253 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 
272 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  29.96 
 
 
243 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  30.3 
 
 
259 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  28.78 
 
 
236 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  26.98 
 
 
330 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  25.96 
 
 
305 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  27.48 
 
 
251 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  29.58 
 
 
296 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  32.65 
 
 
227 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  26.46 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  27.98 
 
 
225 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  26.86 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  28.5 
 
 
225 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  28.5 
 
 
225 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  28.5 
 
 
225 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  28.5 
 
 
225 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  23.96 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  23.96 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  28.5 
 
 
225 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  23.96 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  30.18 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  23.96 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  33.33 
 
 
225 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  33.33 
 
 
225 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  32.65 
 
 
225 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  44.7 
 
 
252 aa  95.9  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>