More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01177 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  100 
 
 
314 aa  646    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  97.44 
 
 
315 aa  601  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  82.11 
 
 
318 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  75.48 
 
 
309 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  59.26 
 
 
322 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  57.23 
 
 
325 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  59.87 
 
 
314 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  58.92 
 
 
309 aa  381  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  59.02 
 
 
308 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  58.97 
 
 
308 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  57.98 
 
 
310 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  57.98 
 
 
310 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  60.44 
 
 
322 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  57.98 
 
 
310 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  57.98 
 
 
306 aa  377  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  57.98 
 
 
306 aa  377  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  57.98 
 
 
310 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  57.98 
 
 
306 aa  377  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  57.65 
 
 
308 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  57.05 
 
 
305 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  59.14 
 
 
318 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  60.59 
 
 
312 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  60.45 
 
 
314 aa  363  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  50.33 
 
 
329 aa  266  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  46.89 
 
 
330 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  46.39 
 
 
280 aa  235  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  43.14 
 
 
305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  40 
 
 
296 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 
277 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  32.14 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 
246 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  27.97 
 
 
275 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  29.93 
 
 
268 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  30.16 
 
 
257 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  27.76 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  27.57 
 
 
245 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  27.78 
 
 
266 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  27.09 
 
 
290 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  27.08 
 
 
261 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  42.03 
 
 
440 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  26.46 
 
 
267 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  25.35 
 
 
271 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  25.42 
 
 
266 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  42.25 
 
 
437 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.43 
 
 
263 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 
275 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  25.17 
 
 
258 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  28.47 
 
 
338 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  36.48 
 
 
248 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  24.83 
 
 
271 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  36.96 
 
 
452 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  39.86 
 
 
438 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  39.86 
 
 
438 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  39.86 
 
 
438 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  39.86 
 
 
438 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  39.86 
 
 
438 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  39.86 
 
 
438 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  28.62 
 
 
241 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  39.86 
 
 
438 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  41.3 
 
 
460 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  32.03 
 
 
271 aa  100  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  37.33 
 
 
259 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  36.96 
 
 
249 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  34.67 
 
 
443 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  35.97 
 
 
406 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3511  putative chemotaxis protein MotB  29.47 
 
 
276 aa  99.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  30.21 
 
 
274 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  26.16 
 
 
280 aa  99.4  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  40.14 
 
 
442 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  39.13 
 
 
460 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  29.76 
 
 
276 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  24 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 
269 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1237  OmpA/MotB  29.86 
 
 
276 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258144  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  26.64 
 
 
286 aa  96.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  25.95 
 
 
254 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  38.41 
 
 
430 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  29.77 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  33.54 
 
 
430 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  32.95 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3363  OmpA/MotB  28.47 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0104995 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  30.3 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  27.62 
 
 
305 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2101  OmpA/MotB  29.1 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.61631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  30.91 
 
 
236 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  39.26 
 
 
415 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2079  OmpA/MotB  28.43 
 
 
273 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299736  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  37.16 
 
 
494 aa  93.2  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  25.26 
 
 
253 aa  92.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  24.04 
 
 
265 aa  92.4  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  27.18 
 
 
256 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  25.95 
 
 
295 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  33.33 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  37.68 
 
 
453 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  27.78 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  38.52 
 
 
421 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  38.52 
 
 
421 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  38.52 
 
 
421 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  25 
 
 
257 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>