More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0328 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  99.76 
 
 
421 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  99.05 
 
 
426 aa  845    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  99.29 
 
 
421 aa  845    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  850    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  99.29 
 
 
421 aa  845    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  99.29 
 
 
421 aa  845    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  72.52 
 
 
443 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  65.52 
 
 
447 aa  557  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  66.75 
 
 
431 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  65.95 
 
 
432 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  67.18 
 
 
434 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  64.16 
 
 
429 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  69.54 
 
 
414 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  50.24 
 
 
415 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  47.07 
 
 
436 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  49.48 
 
 
434 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  48.7 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  48.7 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  48.45 
 
 
434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  48.45 
 
 
434 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  47.66 
 
 
433 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  46.88 
 
 
433 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  47.4 
 
 
433 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  47.4 
 
 
433 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  39.63 
 
 
458 aa  289  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  39.16 
 
 
458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  40 
 
 
443 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  39.75 
 
 
452 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  39.56 
 
 
410 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.9 
 
 
404 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  42.3 
 
 
430 aa  246  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  39.46 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  39.47 
 
 
440 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  40.62 
 
 
413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  40.2 
 
 
405 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  37.63 
 
 
438 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  37.63 
 
 
438 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  37.63 
 
 
438 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  37.63 
 
 
438 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  37.63 
 
 
438 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  37.63 
 
 
438 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  37.63 
 
 
438 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  38.34 
 
 
437 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  38.9 
 
 
460 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  39.55 
 
 
460 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  39.53 
 
 
406 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  36.96 
 
 
442 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  37.29 
 
 
449 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  36.8 
 
 
449 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  35.49 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3181  hypothetical protein  46.85 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.117699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  29.38 
 
 
429 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  30.71 
 
 
469 aa  193  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1824  hypothetical protein  43.6 
 
 
308 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  29.31 
 
 
430 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  33.16 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  38.85 
 
 
278 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  39.56 
 
 
327 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  37.03 
 
 
438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  29.91 
 
 
511 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  37.26 
 
 
290 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  31.44 
 
 
493 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.29 
 
 
494 aa  139  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  34.22 
 
 
293 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  35.32 
 
 
291 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  32.91 
 
 
289 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1672  OmpA/MotB domain protein  27.12 
 
 
431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  32.91 
 
 
289 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  32.91 
 
 
291 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  28.42 
 
 
487 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  28.07 
 
 
594 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  27.79 
 
 
552 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  27.79 
 
 
571 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  27.79 
 
 
552 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  27.52 
 
 
571 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  27.52 
 
 
552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  27.52 
 
 
552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  33.48 
 
 
275 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  27.52 
 
 
560 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  26.8 
 
 
536 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  26.8 
 
 
536 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  26.8 
 
 
535 aa  113  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2876  DotU family type IV/VI secretion system protein  39.41 
 
 
201 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  31.07 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  30.31 
 
 
463 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  30.3 
 
 
271 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  30.51 
 
 
453 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  32.56 
 
 
257 aa  99.8  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  28.25 
 
 
273 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  29.25 
 
 
282 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  26.87 
 
 
257 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.43 
 
 
258 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2000  OmpA/MotB domain protein  40.88 
 
 
167 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297177  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  27.75 
 
 
257 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  31.61 
 
 
252 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  27.2 
 
 
289 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  31.61 
 
 
252 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  27.2 
 
 
289 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  27.56 
 
 
261 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>