More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2786 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  100 
 
 		 308 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  85.29 
 
 		 318 aa  526  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  82.68 
 
 		 310 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  82.68 
 
 		 310 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  82.68 
 
 		 310 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  82.68 
 
 		 310 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  76.88 
 
 		 325 aa  511  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  80.58 
 
 		 314 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  81.4 
 
 		 308 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  81.31 
 
 		 306 aa  502  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  76.8 
 
 		 322 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  81.31 
 
 		 306 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  81.31 
 
 		 306 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  80 
 
 		 308 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  79.74 
 
 		 312 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  75.94 
 
 		 322 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  68.44 
 
 		 305 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  64.29 
 
 		 309 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  63.9 
 
 		 314 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  59.29 
 
 		 315 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  58.65 
 
 		 314 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  59.61 
 
 		 309 aa  381  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  58.12 
 
 		 318 aa  371  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  52 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  46.58 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  42.16 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  44.48 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  41.98 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  31.83 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  28.98 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  29.14 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  30.8 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  29.9 
 
 		 275 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  28.62 
 
 		 266 aa  119  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  29.63 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  30.74 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  28.62 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  30.25 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  27.72 
 
 		 241 aa  106  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  27.24 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  29.54 
 
 		 259 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  42.62 
 
 		 266 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  34.64 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  28.07 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  25.25 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  28.9 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  28.83 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  28.11 
 
 		 245 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  25.75 
 
 		 266 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  26.32 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  26.32 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  28.67 
 
 		 248 aa  97.4  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  26.52 
 
 		 271 aa  97.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  25 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  25.71 
 
 		 271 aa  95.9  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  30.95 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  25.54 
 
 		 258 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  26.09 
 
 		 254 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.98 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  26.28 
 
 		 305 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  27.4 
 
 		 262 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  27.4 
 
 		 262 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  42.06 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  24.74 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  30.99 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  42.06 
 
 		 225 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  38.19 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  42.06 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  41.12 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  41.12 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  41.12 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  29.12 
 
 		 248 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  27.05 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  27.5 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  41.12 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  41.12 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  33.73 
 
 		 256 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  29.01 
 
 		 274 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2101  OmpA/MotB  29.31 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.61631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  23.33 
 
 		 295 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3511  putative chemotaxis protein MotB  29.49 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  32.56 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  39.32 
 
 		 227 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  36.69 
 
 		 430 aa  90.1  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  25.36 
 
 		 253 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  41.12 
 
 		 225 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  34.87 
 
 		 225 aa  89.7  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1237  OmpA/MotB  30.61 
 
 		 276 aa  89.4  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  35.51 
 
 		 442 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  25.62 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  27.92 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  26.28 
 
 		 257 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  28.47 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  38.58 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  36.17 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  25.27 
 
 		 262 aa  86.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  26.57 
 
 		 285 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  26.41 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 257 aa  85.9  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>