More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4286 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  100 
 
 		 275 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  30.63 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  31.33 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  31.33 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  31.33 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  31.15 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  31 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  30.72 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  31.92 
 
 		 308 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  32.03 
 
 		 309 aa  138  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  31.82 
 
 		 315 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  31.7 
 
 		 310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  31.7 
 
 		 310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  31.7 
 
 		 310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  29.05 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  31.7 
 
 		 310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  31.68 
 
 		 318 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  31.27 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  30.57 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  31.61 
 
 		 314 aa  135  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.95 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  31.91 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  31.17 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  32.6 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  33.21 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  31.29 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  31.51 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  30.19 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  29.04 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 258 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  30.8 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  29.51 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  34.3 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  32.08 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  32.08 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  30.28 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  31.7 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  28.89 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  33.22 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  31.75 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  31.7 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  31.46 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  30.77 
 
 		 330 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  30.71 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  30.34 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  32.59 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  29.64 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  29.59 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  30.94 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  31.32 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  27.95 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  31.48 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  30.3 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  31.06 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  30.08 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  32.21 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  30.83 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  30.83 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  30.85 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  31.02 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  32.95 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  28.79 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  29.13 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  27.65 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  27.27 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  29.37 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  31.11 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  25.8 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  29.37 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  31.84 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  30.55 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  34.25 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  29.25 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  26.04 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  31.95 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  27.92 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  28.69 
 
 		 269 aa  99  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  28.24 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  31.76 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0748  OmpA/MotB domain-containing protein  28.07 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  27.62 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  32.41 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  30.43 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  32.34 
 
 		 259 aa  96.3  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  29.26 
 
 		 238 aa  95.9  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2016  OmpA/MotB domain protein  28.43 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  30.97 
 
 		 266 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  31.89 
 
 		 251 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  28.9 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  28.52 
 
 		 323 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  28.63 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1169  OmpA/MotB domain protein  30.26 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00345179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3511  putative chemotaxis protein MotB  30.04 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  27.56 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.77 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  25.33 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  37.78 
 
 		 442 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  28.46 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>