More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0748 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0748  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
302 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 
295 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2016  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 
305 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  37.55 
 
 
290 aa  169  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  32.49 
 
 
261 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  36.7 
 
 
295 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  34.75 
 
 
342 aa  156  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0967  OmpA/MotB domain protein  41.11 
 
 
313 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  30.11 
 
 
257 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  34.59 
 
 
266 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  29.96 
 
 
275 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 
275 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  30.79 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  31.75 
 
 
271 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 
271 aa  142  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  31.27 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  32.33 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  30.51 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  31.84 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  32.28 
 
 
288 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  31.07 
 
 
286 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  28.84 
 
 
259 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  31.99 
 
 
249 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  30.29 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  31.05 
 
 
258 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  29.78 
 
 
267 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  29.45 
 
 
254 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  31.23 
 
 
280 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  31.05 
 
 
290 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0148  OmpA/MotB domain protein  33.82 
 
 
258 aa  122  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  27.92 
 
 
269 aa  122  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  28.78 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  27.82 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  27.82 
 
 
262 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  32.22 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  27.33 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  28.83 
 
 
238 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  28.04 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  27.34 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  27.44 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  27.07 
 
 
262 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  26.12 
 
 
245 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  27.07 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  27.82 
 
 
261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  30.22 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  30.41 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  27.82 
 
 
261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  27.21 
 
 
296 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  27.5 
 
 
244 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  27.31 
 
 
296 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  28.74 
 
 
288 aa  105  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  28.62 
 
 
259 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  28.07 
 
 
275 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  26.1 
 
 
295 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  28.83 
 
 
241 aa  99.8  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  24.82 
 
 
273 aa  99  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.11 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  26.05 
 
 
269 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  26.82 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  25.38 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  25.46 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  27.94 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  28.77 
 
 
305 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  25.27 
 
 
273 aa  95.9  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  25.68 
 
 
305 aa  95.5  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  29.07 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  25.09 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  25.46 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  25.09 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  25.83 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  25.18 
 
 
239 aa  93.2  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  27.55 
 
 
257 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  26.09 
 
 
256 aa  92.4  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  23.65 
 
 
325 aa  92.4  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  24.33 
 
 
236 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  27.49 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  25.09 
 
 
271 aa  91.7  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  24.21 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  25.77 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  22.85 
 
 
329 aa  86.3  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  22.63 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  29.06 
 
 
251 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.74 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  25.88 
 
 
243 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  22.81 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  23.16 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  21.83 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  33.14 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  32.22 
 
 
525 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  20.77 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2320  OmpA/MotB domain-containing protein  29.12 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000584823  hitchhiker  0.000182851 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  25.58 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  21.97 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  21.94 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  21.94 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  21.94 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  21.94 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  22.41 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  22.68 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>