More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1525 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  100 
 
 		 329 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  38.17 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  38.17 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  37.79 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  38.55 
 
 		 285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  37.55 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  36.92 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  35.77 
 
 		 269 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  36.78 
 
 		 296 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  36.15 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  38.08 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 288 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  33.46 
 
 		 260 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  32.1 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  32.34 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  31.27 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  33.2 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  32.45 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  33.33 
 
 		 273 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  33.33 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  31.46 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  29.96 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  32.95 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  29.93 
 
 		 275 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  33.83 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  34.63 
 
 		 267 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  31.88 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  33.57 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  33.7 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 238 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.21 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  30.45 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  31.14 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  30.12 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  28.97 
 
 		 257 aa  119  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  30.4 
 
 		 263 aa  119  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  30.35 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  31.68 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  29.39 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  26.23 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  29.92 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  27.41 
 
 		 249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  29.27 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  31.33 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  25.35 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  28.79 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  27.08 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  28.3 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  29.8 
 
 		 265 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  31.08 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  26.62 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3422  OmpA/MotB domain-containing protein  28.73 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  25.62 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  25.88 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  30.4 
 
 		 245 aa  99.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  29.53 
 
 		 251 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  29.39 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  29.39 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  29.62 
 
 		 236 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  28 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  29.44 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  29.44 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  30.56 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  36.69 
 
 		 179 aa  94.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  29.39 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  29.39 
 
 		 262 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  29.39 
 
 		 262 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  29.55 
 
 		 290 aa  90.1  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 252 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  29.23 
 
 		 266 aa  90.1  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  27.8 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  23.57 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1169  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 266 aa  87.4  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00345179  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  30.35 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 256 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0748  OmpA/MotB domain-containing protein  23.49 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  30.13 
 
 		 251 aa  86.7  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  26.86 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  35.86 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  26.13 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  29.1 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  24.74 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  25.54 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  24.74 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  23.45 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  37.72 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  23.32 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  24.49 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  28.69 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  24.49 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  24.49 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  23.83 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  28.34 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  26.83 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  24.44 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1593  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.907299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  23.67 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  23.1 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  34.53 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  23.1 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>