More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31110 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  100 
 
 
295 aa  593  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2016  OmpA/MotB domain protein  49.83 
 
 
305 aa  277  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  39.4 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  41.48 
 
 
290 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  39.5 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  38.55 
 
 
257 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0967  OmpA/MotB domain protein  42.65 
 
 
313 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 
271 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  33.58 
 
 
271 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  34.93 
 
 
275 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  35.46 
 
 
280 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  34.72 
 
 
259 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0748  OmpA/MotB domain-containing protein  36.23 
 
 
302 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 
268 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  32.88 
 
 
261 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  34.18 
 
 
267 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 
253 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  34.67 
 
 
254 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  33.33 
 
 
249 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  31.05 
 
 
275 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  33.58 
 
 
266 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  34.69 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  32.6 
 
 
267 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  31.39 
 
 
238 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0148  OmpA/MotB domain protein  37.55 
 
 
258 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  35.82 
 
 
290 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 
305 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.57 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  32.73 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  36 
 
 
288 aa  139  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 
245 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  33.09 
 
 
258 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  31.8 
 
 
244 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  31.2 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  31.58 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  32.96 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  33.33 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  32.22 
 
 
285 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  32.96 
 
 
285 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  30.97 
 
 
265 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  33.69 
 
 
305 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  33.86 
 
 
269 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  30.22 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  31.85 
 
 
285 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  32.58 
 
 
296 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  31.46 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  31.46 
 
 
262 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  31.46 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  32.23 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  32.98 
 
 
338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  32.33 
 
 
285 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  32.71 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  30.08 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  32.21 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  32.21 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  32.46 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  33.2 
 
 
251 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  29.75 
 
 
288 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  31.34 
 
 
296 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  33.09 
 
 
263 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  33.91 
 
 
275 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  31.46 
 
 
295 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  31.02 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  29.58 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  30.42 
 
 
259 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  33.98 
 
 
257 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  30.66 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  31.2 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  28.78 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  31.25 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  29.63 
 
 
329 aa  115  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  29.73 
 
 
296 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  30.71 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 
251 aa  112  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.8 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  31.42 
 
 
259 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  30.68 
 
 
246 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  28.37 
 
 
305 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  32.58 
 
 
242 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2473  OmpA/MotB domain protein  31.42 
 
 
259 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.106364  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  27.57 
 
 
241 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  26.9 
 
 
312 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  27.11 
 
 
309 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4407  chemotaxis protein motB, C-terminus  34.72 
 
 
156 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  26.3 
 
 
308 aa  99  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  26.95 
 
 
330 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  27.56 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  23.84 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  26.86 
 
 
309 aa  97.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  25 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  26.97 
 
 
248 aa  96.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  26.88 
 
 
241 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  46.55 
 
 
283 aa  96.3  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  30.23 
 
 
266 aa  95.5  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  28.63 
 
 
239 aa  95.1  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1807  OmpA/MotB  28.77 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.423379  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  27.95 
 
 
253 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  34.51 
 
 
225 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>