More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1807 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1807  OmpA/MotB  100 
 
 
229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.423379  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  35.41 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  33.77 
 
 
269 aa  128  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  31.93 
 
 
263 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  30.59 
 
 
244 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  31.76 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  30.47 
 
 
273 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  27.59 
 
 
267 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  30.53 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  31.95 
 
 
257 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  30.61 
 
 
279 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  26.74 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  29.54 
 
 
246 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  28.39 
 
 
275 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  31.16 
 
 
288 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  29.12 
 
 
257 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  27.92 
 
 
261 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  26.84 
 
 
245 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  30.8 
 
 
290 aa  104  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  28.98 
 
 
249 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  26.84 
 
 
257 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  29.49 
 
 
266 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  29.02 
 
 
295 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  28.87 
 
 
269 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  27.52 
 
 
288 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  26.44 
 
 
271 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  26.27 
 
 
275 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.1 
 
 
263 aa  99.4  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  28.74 
 
 
285 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  27.95 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  28.06 
 
 
295 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  28.35 
 
 
285 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  27.53 
 
 
253 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  28.69 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 
305 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  30.57 
 
 
241 aa  96.3  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  30.41 
 
 
253 aa  95.9  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  27.56 
 
 
285 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  30.27 
 
 
296 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  26.29 
 
 
261 aa  95.5  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  31 
 
 
275 aa  95.5  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  27.53 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  25.29 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  29.39 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  25.89 
 
 
305 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  27.1 
 
 
280 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  26.64 
 
 
296 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  27.1 
 
 
281 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  30.91 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  26.95 
 
 
262 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  30.09 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  30.09 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  26.95 
 
 
262 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  32.78 
 
 
287 aa  92.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  25.56 
 
 
266 aa  92  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  25.4 
 
 
262 aa  92  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  24.24 
 
 
256 aa  91.7  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  27.87 
 
 
296 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  25.4 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  28.4 
 
 
271 aa  90.9  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  24.71 
 
 
265 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  27.24 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  32.34 
 
 
289 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  25 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  30.45 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  28.04 
 
 
295 aa  89.4  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  28.1 
 
 
236 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  27.13 
 
 
268 aa  89.4  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  29.65 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  36.22 
 
 
242 aa  89  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  27.5 
 
 
260 aa  88.6  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  25.1 
 
 
261 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  23.55 
 
 
259 aa  88.6  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  25.1 
 
 
261 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4600  OmpA/MotB domain protein  29.47 
 
 
222 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  30.58 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  29.61 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  36.5 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  24.52 
 
 
271 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  30.7 
 
 
251 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  31.73 
 
 
228 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  25.4 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  34.13 
 
 
283 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2358  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.92 
 
 
226 aa  85.5  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995561  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1539  motB protein, putative  28.33 
 
 
245 aa  85.1  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.198619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  26.81 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  38.28 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  26.01 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  25.93 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  26.01 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  26.55 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  26.55 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  27.09 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  26.55 
 
 
225 aa  82  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  26.55 
 
 
225 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  29.26 
 
 
280 aa  82  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  26.55 
 
 
225 aa  82  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  25.33 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1716  chemotaxis protein PomB  30.84 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.81071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>