More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1251 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  100 
 
 
263 aa  526  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  49.42 
 
 
279 aa  227  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  48.96 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  48.22 
 
 
288 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  42.31 
 
 
267 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  45.15 
 
 
269 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  43.44 
 
 
296 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  42.56 
 
 
285 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  42.98 
 
 
285 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  42.56 
 
 
285 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  42.15 
 
 
285 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  43.57 
 
 
295 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  42.62 
 
 
296 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  42.21 
 
 
295 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  37.99 
 
 
338 aa  182  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  39.63 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  41.74 
 
 
296 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  39.56 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  43.93 
 
 
288 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  37.92 
 
 
305 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  37.13 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  36.71 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  41.77 
 
 
260 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  39.44 
 
 
257 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  34.43 
 
 
271 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  35.02 
 
 
244 aa  149  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.45 
 
 
263 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  34.77 
 
 
271 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  35.25 
 
 
280 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  36.78 
 
 
261 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  37.77 
 
 
257 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  36.51 
 
 
269 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 
258 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  36.36 
 
 
249 aa  142  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  35.18 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  33.72 
 
 
265 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  33.73 
 
 
271 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 
223 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  31.8 
 
 
238 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  34.82 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  33.74 
 
 
262 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  33.74 
 
 
262 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  33.2 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 
275 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  32.78 
 
 
261 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  32.78 
 
 
261 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  34.82 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  34.8 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  35.02 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  35.27 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  34.41 
 
 
262 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  34.41 
 
 
262 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  35.71 
 
 
230 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  36.12 
 
 
223 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  36.12 
 
 
223 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  33.2 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  36.12 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  35.68 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  35.89 
 
 
290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  33.48 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  31.56 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 
219 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  30.74 
 
 
329 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  34.48 
 
 
251 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  35.83 
 
 
259 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1807  OmpA/MotB  31.93 
 
 
229 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.423379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  33.33 
 
 
295 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  32.92 
 
 
236 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  34.03 
 
 
271 aa  118  9e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  37.77 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  33.05 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.02 
 
 
259 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  35.59 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  26.62 
 
 
266 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  32.31 
 
 
239 aa  115  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4600  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 
222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  31 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  30.82 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  31.73 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3422  OmpA/MotB domain-containing protein  33.72 
 
 
272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402253  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  30.27 
 
 
266 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  30.57 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2358  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.56 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995561  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  34.08 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  31.85 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  28.92 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  28.23 
 
 
259 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0748  OmpA/MotB domain-containing protein  29.68 
 
 
302 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  32.75 
 
 
266 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  32.81 
 
 
277 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  30.42 
 
 
272 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0967  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
313 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2473  OmpA/MotB domain protein  36.02 
 
 
259 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.106364  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  30.32 
 
 
329 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  29.73 
 
 
296 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  43.38 
 
 
283 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  36.71 
 
 
252 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  36.08 
 
 
287 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>