More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3028 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  100 
 
 		 266 aa  548  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  79.78 
 
 		 267 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  65.27 
 
 		 253 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  65.38 
 
 		 254 aa  351  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  64.89 
 
 		 258 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  62.41 
 
 		 271 aa  342  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  59.41 
 
 		 271 aa  339  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  55.35 
 
 		 280 aa  298  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.15 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  40.23 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  35.82 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  38.74 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  36.6 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  35.61 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  34.22 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  37.31 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  38.11 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  35.41 
 
 		 245 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  38.04 
 
 		 290 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  36.76 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  35.57 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  35.94 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  35.57 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  36.36 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  35.43 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  35.27 
 
 		 295 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  34.45 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  33.21 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  34.89 
 
 		 305 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  33.98 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  34.39 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  34.5 
 
 		 295 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  35.37 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  35.37 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  34.9 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  34.8 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  33.21 
 
 		 281 aa  149  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  34 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  34 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  32.17 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  33.46 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2016  OmpA/MotB domain protein  34.52 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  34.7 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  32.72 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  35.32 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.88 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  33.7 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  34.92 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  33.73 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  30.53 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  35.1 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  33.47 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  34.63 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  33.98 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  37.3 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  32.48 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  32.49 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  33.88 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2473  OmpA/MotB domain protein  33.47 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.106364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  33.2 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  34.65 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  30.19 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  33.74 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  33.73 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  31.95 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2980  OmpA/MotB domain protein  32.16 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.567172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  33.03 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0748  OmpA/MotB domain-containing protein  28.78 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  33.72 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  32.57 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  29.41 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  31.68 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4407  chemotaxis protein motB, C-terminus  39.86 
 
 		 156 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  43.79 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  30.04 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  28.32 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  35.25 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  29.83 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  29.83 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  29.83 
 
 		 227 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  29.3 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  29.18 
 
 		 342 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  31.94 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  29.83 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  29.83 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  29.83 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  29.83 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  29.83 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0967  OmpA/MotB domain protein  34.63 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  29.83 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  33.09 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  31.66 
 
 		 277 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  32.79 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  29.41 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  40.69 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>