More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_45540 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  100 
 
 
296 aa  600  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  96.96 
 
 
296 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  72.63 
 
 
269 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  69.72 
 
 
285 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  70.36 
 
 
285 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  70 
 
 
285 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  68.15 
 
 
285 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  65.78 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  65.66 
 
 
295 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  64.98 
 
 
295 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  49.81 
 
 
260 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  43.66 
 
 
305 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  44.58 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  45.31 
 
 
279 aa  218  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  41.48 
 
 
338 aa  218  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  40.96 
 
 
286 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  41.64 
 
 
305 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  42.91 
 
 
288 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  39.68 
 
 
267 aa  188  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  42.98 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  39.52 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  38.58 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  41.38 
 
 
257 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  37.55 
 
 
329 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  35.23 
 
 
271 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  33.59 
 
 
271 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 
271 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  36.76 
 
 
266 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  36.43 
 
 
267 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 
257 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  36.33 
 
 
254 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 
253 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  34.39 
 
 
275 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 
269 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  34.36 
 
 
280 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  34.44 
 
 
238 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  33.87 
 
 
261 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.18 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  33.6 
 
 
275 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  35.74 
 
 
257 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  34.88 
 
 
249 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3422  OmpA/MotB domain-containing protein  39.33 
 
 
272 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402253  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  34.65 
 
 
244 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  34.87 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  34.69 
 
 
268 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  33.46 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  31.56 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  35.39 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  31.62 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  31.28 
 
 
236 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  29.54 
 
 
271 aa  125  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  32.55 
 
 
261 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  32.55 
 
 
261 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  32.16 
 
 
261 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  35.86 
 
 
251 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  31.54 
 
 
262 aa  122  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  31.54 
 
 
262 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  32.44 
 
 
246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  30.65 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  30.65 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  30.65 
 
 
262 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  28.21 
 
 
295 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  30.71 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  28.98 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  29.55 
 
 
259 aa  116  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  31.08 
 
 
323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  30.27 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  31.32 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  34.16 
 
 
219 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2016  OmpA/MotB domain protein  30.04 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  32.79 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  42.54 
 
 
289 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  28.63 
 
 
230 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  30.61 
 
 
251 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  30.74 
 
 
272 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  36.59 
 
 
256 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  41.79 
 
 
287 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  34.06 
 
 
252 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  32.02 
 
 
259 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  34.03 
 
 
264 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1169  OmpA/MotB domain protein  28.16 
 
 
266 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00345179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  34.78 
 
 
292 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  31.28 
 
 
223 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.02 
 
 
259 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  39.84 
 
 
179 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  33.48 
 
 
253 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  33.47 
 
 
223 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  33.47 
 
 
223 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4600  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
222 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  29.96 
 
 
228 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  39.5 
 
 
242 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  31.44 
 
 
228 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0386  OmpA/MotB  29.37 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  29.92 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2473  OmpA/MotB domain protein  32.46 
 
 
259 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.106364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  35.9 
 
 
227 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  27.84 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>