More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0386 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0386  OmpA/MotB  100 
 
 		 248 aa  513  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  31.71 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  31.2 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  30.66 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  30.88 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  31.37 
 
 		 267 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  29.46 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  31.2 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  29.37 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  30.28 
 
 		 285 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  29.48 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  29.48 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  29.08 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  30.4 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  30.04 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  30.95 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  30.8 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  30.43 
 
 		 295 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  29.67 
 
 		 338 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  30.27 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  29.64 
 
 		 295 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  30.04 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  29.48 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  28.85 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  29.05 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  28.97 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  29.63 
 
 		 275 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  29.11 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  36.42 
 
 		 323 aa  97.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  30.17 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  29.3 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  30.5 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  30.73 
 
 		 230 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 313 aa  95.5  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  27.6 
 
 		 443 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  27.52 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 313 aa  92.8  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.68 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.300073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  30.57 
 
 		 269 aa  92  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  27.57 
 
 		 298 aa  92  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  30.2 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  29.58 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  30.2 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  26.29 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  30.05 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  30.05 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  34.27 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  28.41 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  27.92 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  28.57 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  29.05 
 
 		 257 aa  89  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  25.9 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  28.69 
 
 		 236 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  25.09 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  26.61 
 
 		 452 aa  88.6  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  34.76 
 
 		 434 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  30.05 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  27.8 
 
 		 345 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  34.15 
 
 		 434 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  34.15 
 
 		 434 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  35.38 
 
 		 511 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1807  OmpA/MotB  32.64 
 
 		 229 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.423379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  29.33 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  34.15 
 
 		 434 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  28.67 
 
 		 314 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  35.94 
 
 		 449 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  35.46 
 
 		 460 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  27.01 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  25.44 
 
 		 336 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  27.01 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  28.64 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  27.01 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  27.01 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  27.01 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  29.43 
 
 		 319 aa  86.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  30.09 
 
 		 264 aa  85.9  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  35.16 
 
 		 449 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  42.99 
 
 		 283 aa  85.9  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  30.38 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  28.46 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4600  OmpA/MotB domain protein  29.85 
 
 		 222 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  28.03 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  27.27 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  36.72 
 
 		 267 aa  85.1  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  38.24 
 
 		 442 aa  85.1  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  29.88 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  30.93 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  30.05 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  32.24 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  30.22 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  26.69 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  34.38 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  29.15 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  41.23 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  32.18 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  26.72 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  28.51 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  27.82 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>