More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0049 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  100 
 
 
336 aa  696    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0055  OmpA/MotB domain-containing protein  68.15 
 
 
336 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3631  OmpA/MotB  64.44 
 
 
330 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.77241  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3946  OmpA/MotB domain-containing protein  60.62 
 
 
306 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3447  OmpA/MotB domain-containing protein  62.09 
 
 
305 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04949  flagellar motor protein  41.64 
 
 
330 aa  255  7e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001165  Flagellar motor rotation protein MotB  41.64 
 
 
330 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3350  hypothetical protein  38.67 
 
 
307 aa  205  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0284  hypothetical protein  38.67 
 
 
307 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.179878  normal  0.584147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0193  OmpA/MotB domain-containing protein  41.55 
 
 
313 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3579  OmpA/MotB domain-containing protein  34.18 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0662  hypothetical protein  38.41 
 
 
303 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0200  hypothetical protein  38.08 
 
 
303 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0382119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0731  hypothetical protein  38.08 
 
 
303 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
301 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0154  chemotaxis lafU protein  37.37 
 
 
311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0202  chemotaxis LafU protein  37.12 
 
 
311 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  33.77 
 
 
345 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  37.54 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  36.72 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 
319 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 
312 aa  162  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  36.51 
 
 
342 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  33.11 
 
 
313 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  36.45 
 
 
349 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  33.11 
 
 
313 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  37.5 
 
 
346 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  36.84 
 
 
346 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  33.22 
 
 
308 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  33.22 
 
 
308 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  37.22 
 
 
350 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  33.22 
 
 
308 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  33.22 
 
 
308 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245861  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  33.22 
 
 
308 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  0.0000000000155511 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  33.22 
 
 
308 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  33.22 
 
 
308 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  33.22 
 
 
308 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  36.42 
 
 
329 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  36.45 
 
 
341 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  33.99 
 
 
296 aa  159  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4666  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 
340 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  33.75 
 
 
306 aa  159  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  34.9 
 
 
355 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.93 
 
 
318 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  33.77 
 
 
290 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  31.86 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  31.86 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  31.86 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  31.86 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  31.86 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  32.78 
 
 
320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  31.91 
 
 
321 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  31.8 
 
 
316 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  32.12 
 
 
377 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4422  OmpA/MotB domain-containing protein  31.12 
 
 
327 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  30.89 
 
 
358 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  31.13 
 
 
433 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  31.13 
 
 
421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  31.13 
 
 
451 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  31.46 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3377  OmpA/MotB domain protein  41.21 
 
 
261 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  33.84 
 
 
360 aa  146  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0275  hypothetical protein  41.21 
 
 
256 aa  146  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0258  hypothetical protein  41.21 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0264  hypothetical protein  41.21 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  29.32 
 
 
314 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  31.39 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2467  flagellar motor protein MotB  33.88 
 
 
309 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0620427  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1504  OmpA/MotB domain-containing protein  32.13 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.962914  normal  0.610699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  33.44 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  32.81 
 
 
327 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5607  flagellar motor protein MotB  31 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707499  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  31.09 
 
 
369 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  28.95 
 
 
308 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1854  OmpA/MotB domain protein  31.27 
 
 
350 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00497305  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03067  flagellar motor protein MotB  32.89 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  30.39 
 
 
308 aa  136  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5983  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 
329 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  31.68 
 
 
344 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  30.92 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  30.92 
 
 
339 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0577  OmpA/MotB domain protein  33.44 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0523993 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  31.37 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  31.37 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  31.37 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0438  flagellar motor protein MotB  33.78 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2612  OmpA/MotB domain protein  30.94 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3356  flagellar motor protein MotB  29.77 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  30.42 
 
 
335 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0163  flagellar motor protein MotB  31.08 
 
 
338 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724048  normal  0.748844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  30.63 
 
 
320 aa  133  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  31.9 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  30.67 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  30.67 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  30.67 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  31.77 
 
 
346 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  31.46 
 
 
298 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  29.32 
 
 
312 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  28.95 
 
 
312 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4046  flagellar motor protein MotB  31.4 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.475556  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>