More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0149 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  901    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  96.88 
 
 		 449 aa  822    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  76.94 
 
 		 453 aa  615  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  49.74 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  49.74 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  49.74 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  49.74 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  49.74 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  49.74 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  49.74 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  50 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  48.95 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  42.43 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  47.71 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  47.24 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  44.82 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  48.17 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  45.53 
 
 		 413 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  46.08 
 
 		 460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  44.85 
 
 		 406 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  35.48 
 
 		 429 aa  276  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  39.74 
 
 		 415 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  33.8 
 
 		 430 aa  249  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  36.43 
 
 		 443 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  37.6 
 
 		 431 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  40.63 
 
 		 433 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  40.63 
 
 		 433 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  40.37 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  39.58 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  32.43 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  39.84 
 
 		 434 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  38.52 
 
 		 436 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  35.1 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  35.68 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  37.76 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  37.76 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  37.76 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  37.5 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  37.5 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  37.5 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  37.5 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  33.82 
 
 		 447 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  34.95 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  36.9 
 
 		 438 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  35.77 
 
 		 434 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  36.49 
 
 		 434 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  35.5 
 
 		 434 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  35.5 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  36.36 
 
 		 414 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  32.01 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  32.01 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  33.25 
 
 		 511 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  39.18 
 
 		 291 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  39.65 
 
 		 293 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  39.66 
 
 		 289 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  39.66 
 
 		 289 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.24 
 
 		 494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  37.8 
 
 		 291 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  33.9 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  43.26 
 
 		 290 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  32.75 
 
 		 410 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  31.77 
 
 		 487 aa  156  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  34.85 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  29.32 
 
 		 493 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.31 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  35.31 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  38.19 
 
 		 275 aa  147  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  41.92 
 
 		 252 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  41.92 
 
 		 252 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  42.51 
 
 		 253 aa  143  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  41.92 
 
 		 253 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  36.1 
 
 		 261 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  40.88 
 
 		 253 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  32.82 
 
 		 278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  36.28 
 
 		 258 aa  136  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  35.4 
 
 		 258 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  33.73 
 
 		 271 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  30.14 
 
 		 404 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  30.75 
 
 		 405 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  40.25 
 
 		 258 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  38.74 
 
 		 273 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  29.1 
 
 		 289 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  30.07 
 
 		 552 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  30.07 
 
 		 552 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  33.02 
 
 		 257 aa  126  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  33.02 
 
 		 257 aa  126  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  29.23 
 
 		 571 aa  126  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  27.84 
 
 		 289 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  29.57 
 
 		 594 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  29.78 
 
 		 552 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  29.78 
 
 		 552 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  37.8 
 
 		 255 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  29.78 
 
 		 571 aa  123  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  37.8 
 
 		 255 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  26.59 
 
 		 289 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  30.16 
 
 		 560 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  29.36 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  32 
 
 		 257 aa  118  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  28.24 
 
 		 536 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>