More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2767 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  100 
 
 		 314 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  87.08 
 
 		 325 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  82.61 
 
 		 322 aa  550  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  84.47 
 
 		 310 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  84.47 
 
 		 310 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  84.47 
 
 		 310 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  84.47 
 
 		 310 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  82.79 
 
 		 308 aa  524  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  81.23 
 
 		 308 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  82.41 
 
 		 306 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  82.41 
 
 		 306 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  82.41 
 
 		 306 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  81.06 
 
 		 322 aa  508  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  79.67 
 
 		 318 aa  502  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  79.61 
 
 		 308 aa  502  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  84.14 
 
 		 312 aa  498  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  67.43 
 
 		 305 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  64.54 
 
 		 309 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  66.77 
 
 		 314 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  61.98 
 
 		 309 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  60.25 
 
 		 314 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  60.19 
 
 		 315 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  58.71 
 
 		 318 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  51.32 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  45.81 
 
 		 330 aa  262  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  44.33 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  40.07 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  44.18 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  36.24 
 
 		 277 aa  149  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  31.29 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  30.56 
 
 		 246 aa  133  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  28.67 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 275 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  28.15 
 
 		 266 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 268 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  30.39 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  30.69 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  29.1 
 
 		 241 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  29.63 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  25.87 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  28.33 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.5 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  25.5 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  26.14 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  44.26 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  27.62 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  25.47 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  30.72 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  24.03 
 
 		 257 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  26.46 
 
 		 261 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  25.68 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1237  OmpA/MotB  30.52 
 
 		 276 aa  99.8  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  23.95 
 
 		 258 aa  99.4  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 271 aa  99  8e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  34.81 
 
 		 225 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  39.86 
 
 		 438 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  39.86 
 
 		 438 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  24.38 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  39.86 
 
 		 438 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  39.86 
 
 		 438 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  27.48 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3511  putative chemotaxis protein MotB  30.13 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  39.86 
 
 		 438 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  40.6 
 
 		 437 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  30.52 
 
 		 274 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  30.49 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  39.86 
 
 		 438 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  39.86 
 
 		 438 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  25 
 
 		 257 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  27.46 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  31.82 
 
 		 225 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  31.82 
 
 		 225 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  38.13 
 
 		 430 aa  96.3  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  28.07 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  34.18 
 
 		 225 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 		 280 aa  95.9  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  38.41 
 
 		 460 aa  95.9  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  25.35 
 
 		 262 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  31.69 
 
 		 236 aa  95.5  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  24.83 
 
 		 262 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  24.75 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  24.07 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  27.78 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  38.69 
 
 		 440 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  33.54 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  42.06 
 
 		 225 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  42.06 
 
 		 225 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  42.06 
 
 		 225 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  42.06 
 
 		 225 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  42.06 
 
 		 225 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  25 
 
 		 271 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  25 
 
 		 261 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  26.49 
 
 		 253 aa  92.8  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  36.96 
 
 		 442 aa  92.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  36.17 
 
 		 443 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2079  OmpA/MotB  29.74 
 
 		 273 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  37.16 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  33.76 
 
 		 227 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>