More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1093 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  100 
 
 
314 aa  641    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  68.04 
 
 
309 aa  430  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  67.63 
 
 
305 aa  428  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  63.84 
 
 
325 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  62.38 
 
 
322 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  65.57 
 
 
308 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  65.15 
 
 
314 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  62.7 
 
 
310 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  62.7 
 
 
310 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  62.7 
 
 
310 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  62.7 
 
 
310 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  62.94 
 
 
308 aa  411  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  64.5 
 
 
318 aa  407  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  63.11 
 
 
308 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  63.43 
 
 
306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  63.43 
 
 
306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  63.43 
 
 
306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  63.75 
 
 
322 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  63.99 
 
 
312 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  61.89 
 
 
318 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  60.45 
 
 
314 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  60.77 
 
 
315 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  58.2 
 
 
309 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  50.98 
 
 
329 aa  272  7e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  46.51 
 
 
330 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  43.79 
 
 
280 aa  225  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  41.47 
 
 
305 aa  208  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  41.84 
 
 
296 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  35.89 
 
 
277 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  32.87 
 
 
266 aa  149  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  29.51 
 
 
275 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  28.72 
 
 
246 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  28.33 
 
 
275 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  27.21 
 
 
268 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  28.72 
 
 
245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  27.3 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  27.53 
 
 
266 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  27.08 
 
 
254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  24.6 
 
 
266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  33.93 
 
 
236 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  27.05 
 
 
257 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  26.1 
 
 
267 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  25 
 
 
261 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  26.42 
 
 
253 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  29.11 
 
 
281 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  35.19 
 
 
225 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  26.57 
 
 
265 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  35.8 
 
 
225 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  35.8 
 
 
225 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  27.62 
 
 
259 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  35.19 
 
 
225 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  35.19 
 
 
225 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  35.19 
 
 
225 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  27.82 
 
 
269 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  35.19 
 
 
225 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  35.19 
 
 
225 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  29.15 
 
 
305 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  34.57 
 
 
225 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  26.92 
 
 
257 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  26.17 
 
 
271 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  32.95 
 
 
271 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  27.11 
 
 
290 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  33.95 
 
 
227 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  34.87 
 
 
225 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  24.5 
 
 
258 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  28.03 
 
 
241 aa  99.8  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  27.21 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  26.41 
 
 
295 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  24.65 
 
 
271 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  25.94 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  29.62 
 
 
276 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  24.91 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  24.49 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  25.32 
 
 
338 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  34.64 
 
 
442 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  25.44 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  28.07 
 
 
251 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  25.17 
 
 
262 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  25.52 
 
 
262 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  24.31 
 
 
238 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  34.78 
 
 
452 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  37.41 
 
 
437 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  36.84 
 
 
460 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  25.26 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.67 
 
 
263 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  35.06 
 
 
438 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  32.56 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  35.06 
 
 
438 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  35.06 
 
 
438 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  35.06 
 
 
438 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  25 
 
 
288 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  35.06 
 
 
438 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  35.51 
 
 
430 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  35.06 
 
 
438 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  35.06 
 
 
438 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  35.34 
 
 
406 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  28.22 
 
 
248 aa  90.5  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  37.23 
 
 
430 aa  90.9  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  32.89 
 
 
443 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  34.25 
 
 
249 aa  90.1  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>