More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2353 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  100 
 
 		 494 aa  993    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  48.49 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  41.69 
 
 		 493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  35.48 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  35.22 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  35.22 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  35.22 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  35.22 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  35.22 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  35.22 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  35.22 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  35.22 
 
 		 440 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  36.46 
 
 		 430 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  37.28 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  32.49 
 
 		 452 aa  203  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  32.15 
 
 		 449 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  31.47 
 
 		 443 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  32.15 
 
 		 449 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  31.68 
 
 		 469 aa  193  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  30.73 
 
 		 430 aa  193  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  29.32 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  32.32 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  32.43 
 
 		 487 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  35.75 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  32.41 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  31.39 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  34.6 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  33.42 
 
 		 511 aa  173  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  31.36 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  31.31 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  32.56 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  30.52 
 
 		 415 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  32.13 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  32.13 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  30.81 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  31.97 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  31.88 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  29.77 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  31.84 
 
 		 436 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  29.19 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  33.84 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  30.75 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  33.13 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  29.47 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  33.43 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  32.84 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  33.13 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  32.17 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  27.85 
 
 		 458 aa  144  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  27.59 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  28.39 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  28.39 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  28.39 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  30.5 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  28.14 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  28.14 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  28.14 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  28.14 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  37 
 
 		 289 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  37 
 
 		 289 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  31.94 
 
 		 453 aa  136  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  37.56 
 
 		 290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  32.16 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  32.04 
 
 		 291 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  30.48 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  32.16 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  33.49 
 
 		 273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  30.47 
 
 		 278 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  29.94 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.29 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  27.63 
 
 		 410 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  38.89 
 
 		 318 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  39.73 
 
 		 256 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  30.18 
 
 		 271 aa  97.1  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  28.91 
 
 		 261 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  37.13 
 
 		 272 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  40.28 
 
 		 330 aa  93.6  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  37.16 
 
 		 314 aa  93.6  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  36.11 
 
 		 308 aa  91.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  27.36 
 
 		 571 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  27.36 
 
 		 552 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  27.36 
 
 		 552 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  33.12 
 
 		 258 aa  91.3  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 		 257 aa  90.9  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  24.88 
 
 		 536 aa  90.9  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  40.8 
 
 		 267 aa  90.5  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 		 251 aa  90.9  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  33.02 
 
 		 263 aa  90.5  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  28.33 
 
 		 594 aa  90.5  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  35.42 
 
 		 306 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  35.42 
 
 		 306 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  35.42 
 
 		 306 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  35.81 
 
 		 315 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  34.03 
 
 		 322 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  31.21 
 
 		 253 aa  89  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  31.21 
 
 		 253 aa  89  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 246 aa  88.2  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  31.48 
 
 		 271 aa  87.8  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  27.12 
 
 		 552 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  24.63 
 
 		 536 aa  87.8  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>