More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6678 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  879    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  83.14 
 
 		 434 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  74.36 
 
 		 433 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  74.36 
 
 		 433 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  73.02 
 
 		 433 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  74.13 
 
 		 433 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  55.47 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  55.21 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  55.21 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  55.21 
 
 		 434 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  49.36 
 
 		 434 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  49.61 
 
 		 431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  46.12 
 
 		 443 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  47.27 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  47.24 
 
 		 458 aa  349  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  45.45 
 
 		 458 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  45 
 
 		 447 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  48.81 
 
 		 426 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  48.81 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  48.81 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  48.81 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  48.54 
 
 		 421 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  48.54 
 
 		 421 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  47.01 
 
 		 415 aa  342  7e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  48.54 
 
 		 421 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  47.78 
 
 		 414 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  43.15 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  37.96 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  38.23 
 
 		 443 aa  262  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  39.8 
 
 		 430 aa  246  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  38.03 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  38.56 
 
 		 440 aa  240  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  37.77 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  37.77 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  37.77 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  37.77 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  37.77 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  37.77 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  37.73 
 
 		 437 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  39.22 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  39.68 
 
 		 442 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  38.4 
 
 		 406 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  38.4 
 
 		 460 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  37.37 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  38.52 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  38.52 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  37.82 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  45.04 
 
 		 278 aa  203  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  34.15 
 
 		 410 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  36 
 
 		 404 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  28.37 
 
 		 430 aa  183  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  31.45 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  36.65 
 
 		 438 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  30.37 
 
 		 429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  34.17 
 
 		 405 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  35.44 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.37 
 
 		 494 aa  160  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2876  DotU family type IV/VI secretion system protein  49.03 
 
 		 201 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  29.18 
 
 		 487 aa  136  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  28.01 
 
 		 536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  28.61 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  34.32 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  33.46 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  27.75 
 
 		 536 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3181  hypothetical protein  34.66 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  35.71 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  28.27 
 
 		 535 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1824  hypothetical protein  33.71 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  32.26 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  29.86 
 
 		 493 aa  126  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  32.69 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  32.79 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  32.79 
 
 		 289 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1672  OmpA/MotB domain protein  26.97 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  32.69 
 
 		 291 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  35.35 
 
 		 261 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  29.29 
 
 		 594 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  35.68 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  32.66 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  34.82 
 
 		 275 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  29.47 
 
 		 571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  29.47 
 
 		 552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  29.47 
 
 		 552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  31.09 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  34.74 
 
 		 258 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  29.22 
 
 		 560 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  29.22 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  29.22 
 
 		 571 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  29.22 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  106  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.94 
 
 		 258 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  32.26 
 
 		 252 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  32.26 
 
 		 252 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  32.8 
 
 		 253 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  32.26 
 
 		 253 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  33.18 
 
 		 273 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  32.26 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  30.39 
 
 		 263 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  36.22 
 
 		 263 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>