More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3486 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  83.17 
 
 		 404 aa  668    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 404 aa  803    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  66.91 
 
 		 405 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  43.54 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  40.29 
 
 		 443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  37.83 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  40.51 
 
 		 414 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  36.84 
 
 		 432 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  38.7 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  38.7 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  38.7 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  36.86 
 
 		 434 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  38.96 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  38.7 
 
 		 421 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  38.7 
 
 		 421 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  38.7 
 
 		 421 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  36.48 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  35.75 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  33.5 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  36.02 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  35.26 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  34.92 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  34.92 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  34.92 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  34.33 
 
 		 436 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  31.87 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  31.87 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  32.12 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  31.87 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 460 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  28.4 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  28.4 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  31.95 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  31.17 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  31.17 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  31.17 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  31.67 
 
 		 437 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  31.17 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  31.17 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  30.57 
 
 		 452 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  31.17 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  31.17 
 
 		 438 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  31.31 
 
 		 440 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  34.35 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  29.5 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  30.35 
 
 		 460 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  29.25 
 
 		 449 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  30.26 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  28.82 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  24.93 
 
 		 469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  28.71 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  24.62 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  28.2 
 
 		 456 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  27.83 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1824  hypothetical protein  38.42 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4998  OmpA/MotB  54.63 
 
 		 119 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3181  hypothetical protein  35.35 
 
 		 313 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.08 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5862  OmpA/MotB domain-containing protein  55.45 
 
 		 103 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.94 
 
 		 494 aa  98.6  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  29.83 
 
 		 463 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  30.03 
 
 		 594 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  37.75 
 
 		 327 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  29.35 
 
 		 552 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  29.35 
 
 		 552 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  29.35 
 
 		 571 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  27.01 
 
 		 278 aa  89.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  29.08 
 
 		 552 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  29.08 
 
 		 571 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  29.08 
 
 		 560 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  29.08 
 
 		 552 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  27.37 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  29.65 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  30.3 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  25.13 
 
 		 536 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  25.13 
 
 		 536 aa  79.7  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  24.5 
 
 		 535 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  29.09 
 
 		 263 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  36.19 
 
 		 291 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  36.19 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  38.73 
 
 		 246 aa  75.5  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  29.37 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  29.37 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  28.65 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  34.93 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  34.93 
 
 		 273 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  29.39 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 215 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  35.51 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  35.51 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  35.51 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  35.51 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  31.41 
 
 		 289 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 244 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  31.41 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  36.23 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  27.39 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  34.81 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  27.97 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  30.69 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>