More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7017 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  882    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  68.65 
 
 
447 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  62.5 
 
 
432 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  68.18 
 
 
443 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  67.7 
 
 
434 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  66.42 
 
 
431 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  64.1 
 
 
414 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  65.08 
 
 
421 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  65.34 
 
 
421 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  65.08 
 
 
421 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  65.08 
 
 
426 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  65.34 
 
 
421 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  65.34 
 
 
421 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  65.08 
 
 
421 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  47.45 
 
 
415 aa  358  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  45.19 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  44.33 
 
 
434 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  44.33 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  44.07 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  44.07 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  43.23 
 
 
433 aa  299  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  43.15 
 
 
436 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  43.23 
 
 
433 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  43.23 
 
 
433 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  42.71 
 
 
433 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  37 
 
 
458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  36.77 
 
 
458 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  37.59 
 
 
410 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  38.01 
 
 
443 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  38.36 
 
 
452 aa  240  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  38.9 
 
 
440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  38.54 
 
 
413 aa  234  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  37.6 
 
 
437 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  40 
 
 
430 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  37.08 
 
 
438 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  37.08 
 
 
438 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  37.08 
 
 
438 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  37.08 
 
 
438 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  37.08 
 
 
438 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  37.08 
 
 
438 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  37.08 
 
 
438 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  38.24 
 
 
406 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.25 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  35.75 
 
 
404 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  36.82 
 
 
405 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  35.26 
 
 
460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1824  hypothetical protein  43.73 
 
 
308 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  36.05 
 
 
442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  34.93 
 
 
453 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3181  hypothetical protein  44.44 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.117699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  36.9 
 
 
449 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  34.95 
 
 
449 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  34.56 
 
 
460 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  39.02 
 
 
327 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  38.61 
 
 
278 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  35.68 
 
 
438 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  29.04 
 
 
469 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  31.39 
 
 
456 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  28.65 
 
 
430 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  27.73 
 
 
429 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30 
 
 
494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  29.36 
 
 
493 aa  137  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  28.47 
 
 
511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  34.91 
 
 
290 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  34.8 
 
 
293 aa  126  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 
453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  30.4 
 
 
453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  31.96 
 
 
289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  31.96 
 
 
289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  29.74 
 
 
463 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  34.25 
 
 
291 aa  117  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  35.63 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  26.49 
 
 
487 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  25.07 
 
 
536 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  24.78 
 
 
536 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  24.78 
 
 
535 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  29.89 
 
 
271 aa  107  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  25.55 
 
 
594 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  25.55 
 
 
552 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  25.55 
 
 
571 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  25.55 
 
 
552 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  26.37 
 
 
257 aa  99  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  25.27 
 
 
560 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  25.27 
 
 
552 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  25.27 
 
 
552 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  25.27 
 
 
571 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.33 
 
 
258 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.63 
 
 
258 aa  97.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  29.28 
 
 
282 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  29.73 
 
 
282 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  25.94 
 
 
289 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  27.04 
 
 
257 aa  96.3  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  25.48 
 
 
289 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2876  DotU family type IV/VI secretion system protein  38.06 
 
 
201 aa  96.3  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.9 
 
 
258 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  26.5 
 
 
289 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  27.75 
 
 
261 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1672  OmpA/MotB domain protein  25.62 
 
 
431 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  27.61 
 
 
273 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  26.05 
 
 
282 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>