105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2876 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2876  DotU family type IV/VI secretion system protein  100 
 
 		 201 aa  420  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  97.19 
 
 		 458 aa  367  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  97.75 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  54.76 
 
 		 434 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  49.03 
 
 		 436 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  51.18 
 
 		 433 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  51.18 
 
 		 433 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  51.18 
 
 		 433 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  51.18 
 
 		 433 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  41.35 
 
 		 443 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  41.79 
 
 		 431 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  34.02 
 
 		 447 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  36.36 
 
 		 415 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  41.06 
 
 		 414 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  45.83 
 
 		 426 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  45.83 
 
 		 421 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  45.83 
 
 		 421 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  45.83 
 
 		 421 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  45.83 
 
 		 421 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  45.83 
 
 		 421 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  45.83 
 
 		 421 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  40.91 
 
 		 434 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  40.94 
 
 		 432 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  38.06 
 
 		 429 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  38.51 
 
 		 434 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  38.51 
 
 		 434 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  38.51 
 
 		 434 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  37.84 
 
 		 434 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  36.61 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  37.96 
 
 		 430 aa  81.6  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1824  hypothetical protein  39.68 
 
 		 308 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  34.51 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  34.48 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  36.44 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  37.3 
 
 		 438 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  37.3 
 
 		 438 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  38.17 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  37.3 
 
 		 438 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  37.3 
 
 		 438 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  37.3 
 
 		 438 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  37.3 
 
 		 438 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  37.3 
 
 		 438 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  37.39 
 
 		 460 aa  72  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  33.9 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.71 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  32.94 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  37.82 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  32.94 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3181  hypothetical protein  32.76 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  39.13 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  29.69 
 
 		 443 aa  68.2  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  34.21 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  34.21 
 
 		 289 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  36.28 
 
 		 327 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  33.62 
 
 		 404 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  33.64 
 
 		 442 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  32.31 
 
 		 405 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  31.3 
 
 		 275 aa  65.1  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  30.33 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  32.14 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  37.65 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  26.54 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  37.65 
 
 		 291 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  30.36 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  31.25 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  31.36 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  29.66 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  26.42 
 
 		 430 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  31.25 
 
 		 449 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  30.25 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  30.25 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  30.77 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  33.61 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  28.81 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  30.51 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  30.51 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  27.59 
 
 		 511 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  26.92 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  27.88 
 
 		 282 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  29.31 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.01 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  29.31 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  30.95 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  30.95 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  29.31 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.32 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1940  hypothetical protein  96 
 
 		 136 aa  53.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000050043  normal  0.408883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.01 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0633  hypothetical protein  100 
 
 		 46 aa  52.4  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0250411  normal  0.0743119 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1440  prophage CP4-57 integrase  66.67 
 
 		 58 aa  52.4  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.294071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  25.45 
 
 		 261 aa  52  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  52  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2676  hypothetical protein  100 
 
 		 41 aa  51.6  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.581829  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0137  hypothetical protein  95.83 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3673  insertion sequence transposase  95.83 
 
 		 78 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000238306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  37.5 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  29.63 
 
 		 257 aa  48.1  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1672  OmpA/MotB domain protein  25.9 
 
 		 431 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  27.35 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  29.63 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>