More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1672 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1672  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 431 aa  872    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2000  OmpA/MotB domain protein  60.95 
 
 		 167 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  27.25 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  27.25 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  27.25 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  27.25 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  27.25 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  27.25 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  27.25 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  25.54 
 
 		 431 aa  124  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  24.64 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  25.6 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  25.48 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  27.4 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  24.18 
 
 		 430 aa  106  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  27.07 
 
 		 410 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  24.94 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  24.64 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  23.06 
 
 		 458 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  23.06 
 
 		 458 aa  99.8  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  25.49 
 
 		 443 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  24.4 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  34.44 
 
 		 436 aa  90.1  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  25.42 
 
 		 438 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  31.47 
 
 		 272 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 288 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  44.92 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  41.53 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  43.33 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  25.66 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  38.37 
 
 		 256 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  34.07 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  40.68 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  33.13 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  34.06 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  38.3 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  38.84 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  37.5 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  39.47 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  41.18 
 
 		 237 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  35.29 
 
 		 366 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  34.53 
 
 		 222 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  41.18 
 
 		 237 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 366 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  33.53 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  34.5 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  33.54 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  36.84 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  34.04 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  23.36 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  40.68 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  38.76 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  35.21 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  29.2 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  30.36 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  35.21 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  45.79 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  38.03 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  32.51 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  24.36 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  45.79 
 
 		 224 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  32.56 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  31.14 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 		 187 aa  75.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  31.14 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1270  OmpA/MotB  35.56 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.752029  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 209 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  31.14 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  37.23 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 243 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  37.78 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  40.94 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  40 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  37.78 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  31.06 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  33.33 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  37.59 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  37.78 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  33.33 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3587  chemotaxis protein MotB  43.75 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  38.98 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  37.8 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  37.04 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  37.41 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.12 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  37.69 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  35.71 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>