More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0137 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0137  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0833  twitching motility protein  98.94 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0831  twitching motility protein  98.41 
 
 		 374 aa  387  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.859854  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0761  twitching motility protein  54.73 
 
 		 340 aa  154  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3449  twitching motility protein  52.38 
 
 		 338 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0548659  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3606  twitching motility protein  51.7 
 
 		 338 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0776  twitching motility protein  49.32 
 
 		 346 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3092  twitching motility family protein  50 
 
 		 341 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184946 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3294  twitching motility family protein  50 
 
 		 326 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3110  twitching motility family protein  49.31 
 
 		 326 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0764  twitching motility protein  49.31 
 
 		 326 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160619  hitchhiker  0.0000267931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4253  twitching motility family protein  49.31 
 
 		 341 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.626068  normal  0.518101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02780  predicted transporter  48.61 
 
 		 326 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02743  hypothetical protein  48.61 
 
 		 326 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.390847  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0745  twitching motility protein  48.61 
 
 		 326 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.55991  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3382  twitching motility family protein  48.61 
 
 		 326 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  42.95 
 
 		 345 aa  126  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  38.51 
 
 		 388 aa  124  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  42.14 
 
 		 383 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3338  twitching mobility protein  44.9 
 
 		 326 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4029  twitching motility protein  52.7 
 
 		 340 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.364781  hitchhiker  0.00141346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3273  twitching mobility protein  43.54 
 
 		 326 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0500481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3262  twitching mobility protein  44.9 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3346  twitching mobility protein  44.9 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732924  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3442  twitching motility protein PilT  43.54 
 
 		 326 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.091783 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  41.89 
 
 		 345 aa  117  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  38.46 
 
 		 386 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3356  twitching motility protein  44.08 
 
 		 326 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  41.18 
 
 		 349 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  41.43 
 
 		 346 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  43.57 
 
 		 360 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  41.43 
 
 		 346 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  41.22 
 
 		 345 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  42.14 
 
 		 345 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  41.26 
 
 		 345 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  39.86 
 
 		 351 aa  115  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  41.22 
 
 		 345 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  40 
 
 		 351 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  42.86 
 
 		 363 aa  114  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  38.51 
 
 		 349 aa  114  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  41.43 
 
 		 383 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  39.86 
 
 		 344 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  42.14 
 
 		 360 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  40.69 
 
 		 344 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  37.14 
 
 		 388 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  43.28 
 
 		 339 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  39.19 
 
 		 347 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  38.46 
 
 		 387 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  39.16 
 
 		 345 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  37.72 
 
 		 352 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  39.86 
 
 		 345 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  36.67 
 
 		 360 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  39.86 
 
 		 345 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  38.51 
 
 		 347 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  39.16 
 
 		 345 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  39.16 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  39.16 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  39.16 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  39.16 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  39.16 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  39.16 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  39.16 
 
 		 349 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  39.16 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  39.16 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  39.16 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  41.26 
 
 		 365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  41.13 
 
 		 366 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  39.19 
 
 		 366 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  39.19 
 
 		 372 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  38.26 
 
 		 437 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  39.19 
 
 		 366 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  41.13 
 
 		 366 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  41.13 
 
 		 366 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  35.14 
 
 		 345 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  39.19 
 
 		 344 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  38.26 
 
 		 427 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  39.19 
 
 		 344 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  34.76 
 
 		 351 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  38.26 
 
 		 427 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  39.19 
 
 		 347 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  38.26 
 
 		 427 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  39.19 
 
 		 347 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  38.85 
 
 		 363 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  39.19 
 
 		 345 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  37.66 
 
 		 362 aa  106  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  38.85 
 
 		 368 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  37.14 
 
 		 387 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  41.01 
 
 		 367 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  40.85 
 
 		 366 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  37.65 
 
 		 360 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  36.76 
 
 		 383 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  35.14 
 
 		 347 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  40.14 
 
 		 350 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  39.57 
 
 		 374 aa  104  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  36.49 
 
 		 344 aa  104  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  36.76 
 
 		 383 aa  104  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  35 
 
 		 382 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  36.49 
 
 		 347 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  38.85 
 
 		 358 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  35.14 
 
 		 347 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>