More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0951 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  100 
 
 
372 aa  753    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  69.32 
 
 
360 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  68.75 
 
 
360 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  57.02 
 
 
351 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  57.31 
 
 
397 aa  401  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  55.84 
 
 
351 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  57.68 
 
 
360 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  56.09 
 
 
368 aa  395  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  57.43 
 
 
362 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  54.29 
 
 
366 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  54.44 
 
 
349 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  54.02 
 
 
366 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  57.79 
 
 
360 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  60.58 
 
 
367 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  53.06 
 
 
368 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  53.82 
 
 
365 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  57.61 
 
 
339 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  53.28 
 
 
374 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  55.91 
 
 
378 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  50.56 
 
 
372 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  54.94 
 
 
350 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  54.65 
 
 
350 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  53.76 
 
 
382 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  52.72 
 
 
365 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  54.65 
 
 
370 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  54.6 
 
 
566 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  51.96 
 
 
366 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  53.33 
 
 
365 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  50.71 
 
 
375 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  51.99 
 
 
365 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  50 
 
 
374 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  51.14 
 
 
366 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  51.87 
 
 
360 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  50.71 
 
 
362 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  51.42 
 
 
366 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  51.42 
 
 
366 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  54.15 
 
 
403 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  52.86 
 
 
351 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  50.14 
 
 
356 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  51.59 
 
 
374 aa  363  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  51.87 
 
 
363 aa  362  6e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  51.16 
 
 
357 aa  362  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  50.7 
 
 
363 aa  361  9e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  51.15 
 
 
360 aa  361  1e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  50.57 
 
 
362 aa  360  2e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  50.68 
 
 
365 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  48.55 
 
 
356 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  51.69 
 
 
430 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  53.12 
 
 
344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  51 
 
 
372 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  51 
 
 
372 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  50.58 
 
 
356 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  49.42 
 
 
356 aa  354  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  53.08 
 
 
348 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  48.3 
 
 
356 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  51.63 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  52.78 
 
 
347 aa  352  4e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  52.07 
 
 
358 aa  352  5e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  50.58 
 
 
349 aa  352  5e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  50.58 
 
 
349 aa  352  5e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  47.98 
 
 
358 aa  351  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  48.64 
 
 
372 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  50.72 
 
 
347 aa  350  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4274  twitching motility protein  50.29 
 
 
356 aa  349  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  49.27 
 
 
344 aa  348  7e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  48.74 
 
 
358 aa  348  7e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  51.17 
 
 
344 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  50.76 
 
 
347 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  50 
 
 
347 aa  347  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  52.3 
 
 
366 aa  347  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  50.76 
 
 
347 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  49.85 
 
 
347 aa  347  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  51.95 
 
 
346 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  50.15 
 
 
349 aa  347  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  48.98 
 
 
344 aa  346  4e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  51.34 
 
 
347 aa  346  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  50.29 
 
 
349 aa  345  7e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  51.35 
 
 
346 aa  345  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  47.56 
 
 
350 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  51.74 
 
 
360 aa  344  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  50.74 
 
 
344 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  48.87 
 
 
358 aa  342  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  51.36 
 
 
347 aa  343  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  50.43 
 
 
369 aa  342  5e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  52.25 
 
 
351 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  50.74 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  49.85 
 
 
347 aa  342  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  50 
 
 
388 aa  342  7e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  50.98 
 
 
366 aa  341  9e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1359  twitching mobility protein  49.72 
 
 
371 aa  341  1e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00791421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  53.15 
 
 
347 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  48.99 
 
 
345 aa  341  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  50.45 
 
 
347 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  50.45 
 
 
347 aa  341  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  50.74 
 
 
344 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  48.25 
 
 
347 aa  340  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  52.25 
 
 
352 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  49.71 
 
 
347 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  51.61 
 
 
346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  51.48 
 
 
345 aa  339  4e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>