More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2070 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  82.87 
 
 		 372 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  100 
 
 		 362 aa  743    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  82.17 
 
 		 374 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  83.71 
 
 		 374 aa  631  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  72.96 
 
 		 372 aa  564  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  72.96 
 
 		 372 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  73.31 
 
 		 372 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  69.47 
 
 		 358 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0019  twitching motility protein  68.89 
 
 		 360 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  62.91 
 
 		 370 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  55.17 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  55.15 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  53.39 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  52.97 
 
 		 357 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  55.59 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  53.45 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  52.25 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  52 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  51.56 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  52.69 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  54.78 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  53.6 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  52.74 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  53.04 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  54.49 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  51.99 
 
 		 365 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  53.31 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  52.17 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  50.57 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  53.03 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  52.69 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  51.69 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  54.95 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  52.74 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  50 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  53.33 
 
 		 347 aa  368  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  49.58 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  52.75 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  53.03 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  52.74 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  51.14 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  50 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  53.33 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  52.75 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  53.45 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  53.31 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  53.33 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  51.7 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  53.03 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  50.71 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  52.74 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  53.45 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  51.43 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  54.07 
 
 		 344 aa  362  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  48.49 
 
 		 566 aa  362  5.0000000000000005e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  53.04 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  51.69 
 
 		 349 aa  362  7.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  52.45 
 
 		 347 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  48.31 
 
 		 365 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  52.45 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  48.87 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  52.94 
 
 		 347 aa  360  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  48.87 
 
 		 366 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  48.87 
 
 		 366 aa  359  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  52.48 
 
 		 345 aa  359  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  48.03 
 
 		 365 aa  359  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  53.62 
 
 		 344 aa  359  5e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  52.19 
 
 		 345 aa  358  7e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  52.19 
 
 		 345 aa  358  7e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  53.62 
 
 		 344 aa  358  8e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  52.27 
 
 		 345 aa  358  8e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  52.19 
 
 		 345 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  51.87 
 
 		 350 aa  357  9.999999999999999e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  52.19 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  51.9 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  51.87 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  50 
 
 		 365 aa  356  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  52.6 
 
 		 346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  52.75 
 
 		 345 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  49.58 
 
 		 362 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  51.92 
 
 		 347 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  51.6 
 
 		 345 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  51.6 
 
 		 345 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  51.6 
 
 		 345 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  51.87 
 
 		 347 aa  355  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  52.51 
 
 		 347 aa  355  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  48.04 
 
 		 374 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  51.9 
 
 		 345 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  51.15 
 
 		 345 aa  355  7.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  52.74 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  51.9 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  51.6 
 
 		 349 aa  354  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  52.74 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  51.59 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  51.31 
 
 		 345 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  51.59 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  52.34 
 
 		 344 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  50.72 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  53.12 
 
 		 344 aa  352  4e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  47.86 
 
 		 360 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>