More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2148 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  100 
 
 
374 aa  771    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  75.36 
 
 
368 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  75.5 
 
 
365 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  73.73 
 
 
365 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  73.16 
 
 
366 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  73.45 
 
 
366 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  74.36 
 
 
366 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  74.64 
 
 
366 aa  559  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  72.88 
 
 
366 aa  557  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  73.65 
 
 
365 aa  555  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  72.91 
 
 
363 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  72.86 
 
 
365 aa  551  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  62.18 
 
 
375 aa  483  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  60.29 
 
 
366 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  59.54 
 
 
362 aa  431  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  56.03 
 
 
367 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  53.76 
 
 
397 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  55.43 
 
 
368 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  55.24 
 
 
360 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  52.82 
 
 
430 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  54.6 
 
 
378 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  52.91 
 
 
370 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  52.11 
 
 
360 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  52.94 
 
 
403 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  54.05 
 
 
344 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  50.97 
 
 
362 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  50.58 
 
 
351 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  51.01 
 
 
349 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  53.27 
 
 
344 aa  364  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  51.59 
 
 
372 aa  363  3e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  49.01 
 
 
372 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  49.01 
 
 
372 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  53.35 
 
 
344 aa  362  8e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  52.98 
 
 
344 aa  361  9e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  52.89 
 
 
347 aa  360  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  52.6 
 
 
344 aa  359  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  53.25 
 
 
345 aa  358  6e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  53.85 
 
 
345 aa  358  6e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  53.25 
 
 
345 aa  358  8e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  52.21 
 
 
566 aa  358  8e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  48.28 
 
 
382 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  52.51 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  51.75 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  52.89 
 
 
344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  53.25 
 
 
345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  51.45 
 
 
347 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  50.14 
 
 
360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  48.62 
 
 
365 aa  355  5e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  53.25 
 
 
345 aa  356  5e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  53.25 
 
 
345 aa  356  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  52.05 
 
 
345 aa  355  5e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  48.04 
 
 
362 aa  355  5.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  53.25 
 
 
345 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  53.12 
 
 
351 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  49.14 
 
 
363 aa  353  2e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  52.31 
 
 
344 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  52.07 
 
 
345 aa  354  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  47.9 
 
 
374 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  48.74 
 
 
372 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  52.37 
 
 
345 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  52.37 
 
 
345 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  52.37 
 
 
345 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  48.45 
 
 
360 aa  352  8e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  54.22 
 
 
339 aa  351  8.999999999999999e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  49.02 
 
 
372 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  48.56 
 
 
360 aa  351  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  50.58 
 
 
344 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  52.71 
 
 
344 aa  350  2e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  52.71 
 
 
344 aa  350  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  48.99 
 
 
360 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  52.07 
 
 
345 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  53.25 
 
 
344 aa  349  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  50.14 
 
 
388 aa  349  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  48.02 
 
 
374 aa  349  4e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  50.28 
 
 
351 aa  349  5e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  52.96 
 
 
345 aa  349  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  49.13 
 
 
347 aa  348  9e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  51.16 
 
 
344 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  51.16 
 
 
344 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0998  putative type II/IV secretion system protein  48.6 
 
 
373 aa  347  3e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  51.76 
 
 
349 aa  346  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  51.49 
 
 
345 aa  346  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  51.76 
 
 
345 aa  345  5e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1251  pilus retraction protein PilT  48.61 
 
 
360 aa  345  6e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  50.89 
 
 
345 aa  345  8.999999999999999e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  51.51 
 
 
344 aa  344  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  49.42 
 
 
347 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  50.58 
 
 
344 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  50.29 
 
 
427 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1145  twitching motility protein PilT  48.58 
 
 
353 aa  343  2e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0148447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  50.29 
 
 
427 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  50.29 
 
 
427 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  50.29 
 
 
347 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  51.16 
 
 
437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  52.65 
 
 
345 aa  343  4e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  50.88 
 
 
347 aa  343  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  50.58 
 
 
386 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  48.87 
 
 
359 aa  341  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  50.87 
 
 
383 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  50.9 
 
 
346 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>