More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2413 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  100 
 
 		 351 aa  722    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  65.9 
 
 		 349 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  61.6 
 
 		 351 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  60.57 
 
 		 350 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  60.29 
 
 		 350 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  59.42 
 
 		 351 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  56.82 
 
 		 360 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  57.94 
 
 		 365 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  58.4 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  56.68 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  54.57 
 
 		 350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  55.37 
 
 		 374 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  54.26 
 
 		 374 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  56.8 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  54.26 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  55.86 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  53.39 
 
 		 362 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  53.91 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  53.06 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  52.45 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  54.05 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  52.54 
 
 		 372 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  52.54 
 
 		 372 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  53.87 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  51.59 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  52.16 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  53.87 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  51.87 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  52.27 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  54.2 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  53.31 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  53.25 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  53.89 
 
 		 365 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  52.16 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  53.03 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  51.29 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  50.58 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  52.45 
 
 		 363 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  52.08 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  51 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  52.86 
 
 		 372 aa  364  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  49.29 
 
 		 382 aa  363  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  51.59 
 
 		 365 aa  362  6e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  50.72 
 
 		 366 aa  362  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  51.57 
 
 		 362 aa  361  8e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  50.14 
 
 		 366 aa  360  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  50.43 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  49.14 
 
 		 388 aa  359  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  50.57 
 
 		 437 aa  358  6e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  50.29 
 
 		 427 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  50.29 
 
 		 427 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  49.71 
 
 		 427 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  51.31 
 
 		 370 aa  354  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  51.78 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  48.68 
 
 		 366 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  50.43 
 
 		 362 aa  353  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  49.13 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  52.38 
 
 		 566 aa  352  5e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  48.85 
 
 		 383 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  48.56 
 
 		 383 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0019  twitching motility protein  49.16 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  46.55 
 
 		 387 aa  349  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  48.56 
 
 		 383 aa  349  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  48.28 
 
 		 387 aa  345  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  49.57 
 
 		 347 aa  345  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  47.99 
 
 		 386 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  48.01 
 
 		 361 aa  344  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  49.4 
 
 		 346 aa  343  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  48.58 
 
 		 370 aa  343  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  49.1 
 
 		 346 aa  342  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  51.82 
 
 		 369 aa  342  5e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  50.14 
 
 		 344 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  50.58 
 
 		 366 aa  342  8e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  46.11 
 
 		 345 aa  341  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  49.27 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  48.85 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  48.07 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  48.82 
 
 		 360 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  49.28 
 
 		 347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  49.11 
 
 		 345 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  50.3 
 
 		 345 aa  338  9e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  50 
 
 		 356 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  49.27 
 
 		 347 aa  337  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  47.83 
 
 		 347 aa  337  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  49.71 
 
 		 356 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  49.14 
 
 		 358 aa  337  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  47.81 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  48.55 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  47.55 
 
 		 358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  49.29 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  48.37 
 
 		 372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  47.99 
 
 		 360 aa  336  5e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  47.81 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  49.28 
 
 		 344 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  48.81 
 
 		 345 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  49.11 
 
 		 345 aa  335  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  46.86 
 
 		 347 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  48.82 
 
 		 360 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  49.11 
 
 		 345 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  49.11 
 
 		 345 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>