More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0969 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  100 
 
 
365 aa  743    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  61.71 
 
 
360 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  57.94 
 
 
351 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  55.37 
 
 
349 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  54.82 
 
 
351 aa  395  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  56.66 
 
 
339 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  51.66 
 
 
366 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  54.04 
 
 
350 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  51.1 
 
 
366 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  51.52 
 
 
350 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  55.78 
 
 
344 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  51.53 
 
 
356 aa  381  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  51.79 
 
 
351 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  54.04 
 
 
350 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  50.83 
 
 
365 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  51.38 
 
 
366 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  52.14 
 
 
365 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  53.19 
 
 
347 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  54.55 
 
 
360 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  50.55 
 
 
365 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  53.42 
 
 
378 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  50.28 
 
 
368 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  54.73 
 
 
360 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  53.03 
 
 
348 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  51.57 
 
 
365 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  51 
 
 
366 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  50.14 
 
 
375 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  53.69 
 
 
367 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  50.72 
 
 
366 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  52.68 
 
 
352 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  51.77 
 
 
374 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  49.72 
 
 
363 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  51.52 
 
 
397 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  53.87 
 
 
362 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  50.68 
 
 
372 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  52.92 
 
 
566 aa  360  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  50.56 
 
 
368 aa  359  5e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  49.05 
 
 
372 aa  358  7e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  50.55 
 
 
382 aa  358  7e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  52.82 
 
 
351 aa  358  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  49.17 
 
 
360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  50 
 
 
362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  49.86 
 
 
347 aa  355  5e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  48.62 
 
 
374 aa  355  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  48.77 
 
 
374 aa  355  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  47.53 
 
 
360 aa  353  2e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  52.07 
 
 
403 aa  353  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  49.45 
 
 
357 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  47.8 
 
 
360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  49.31 
 
 
360 aa  352  8e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  48.08 
 
 
363 aa  351  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  50.42 
 
 
370 aa  351  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  51.13 
 
 
372 aa  351  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  49.45 
 
 
366 aa  351  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0165  twitching motility protein  49.86 
 
 
360 aa  350  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.753648  normal  0.198553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  49.73 
 
 
356 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  51.27 
 
 
369 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  50.14 
 
 
350 aa  348  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  50.28 
 
 
347 aa  347  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  46.3 
 
 
358 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  50.55 
 
 
347 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  49.45 
 
 
356 aa  346  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  50.14 
 
 
347 aa  347  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  49.03 
 
 
344 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  48.88 
 
 
345 aa  346  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  49.03 
 
 
344 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  49.16 
 
 
345 aa  345  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  48.32 
 
 
345 aa  345  8e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  48.04 
 
 
345 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  47.91 
 
 
347 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  48.23 
 
 
372 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  50.69 
 
 
347 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  48.23 
 
 
372 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  49.72 
 
 
357 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  49.3 
 
 
344 aa  343  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  48.32 
 
 
345 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  48.32 
 
 
345 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  50.14 
 
 
347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  48.32 
 
 
345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  50.14 
 
 
347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  50.42 
 
 
347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  47.49 
 
 
345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  49.72 
 
 
356 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  48.04 
 
 
345 aa  342  5e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  50.14 
 
 
344 aa  342  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  47.77 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  47.49 
 
 
349 aa  342  7e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  47.53 
 
 
360 aa  342  7e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  47.95 
 
 
372 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  48.75 
 
 
344 aa  341  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  50.14 
 
 
344 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  49.73 
 
 
370 aa  341  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  49.72 
 
 
347 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  49.3 
 
 
347 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  49.45 
 
 
356 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  47.91 
 
 
347 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  49.31 
 
 
344 aa  340  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  47.21 
 
 
345 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  49.3 
 
 
344 aa  339  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  47.21 
 
 
345 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>