More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1724 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  100 
 
 
360 aa  720    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  61.71 
 
 
365 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  56.82 
 
 
351 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  57.54 
 
 
349 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  57.26 
 
 
351 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  60.29 
 
 
351 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  58.99 
 
 
350 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  58.71 
 
 
350 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  55 
 
 
356 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  63.22 
 
 
339 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  58.59 
 
 
368 aa  412  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  54.87 
 
 
350 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  58.5 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  57.1 
 
 
374 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  55.31 
 
 
366 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  55.74 
 
 
366 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  55.03 
 
 
366 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  56.61 
 
 
370 aa  398  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  54.27 
 
 
372 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  55.18 
 
 
365 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  55.31 
 
 
365 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  53.44 
 
 
374 aa  391  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  55.15 
 
 
362 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  57.65 
 
 
344 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  57.79 
 
 
372 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  53.89 
 
 
365 aa  388  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  53.04 
 
 
368 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  54.83 
 
 
397 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  56.68 
 
 
348 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  54.44 
 
 
366 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  56.18 
 
 
347 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  56.62 
 
 
367 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  56.4 
 
 
350 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  54.34 
 
 
365 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  54.44 
 
 
366 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  53.07 
 
 
375 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  57.18 
 
 
352 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  54.06 
 
 
362 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  54.94 
 
 
360 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  56.16 
 
 
378 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  53.91 
 
 
372 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  52.34 
 
 
382 aa  378  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  57.46 
 
 
403 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  53.07 
 
 
363 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  53.35 
 
 
372 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  53.35 
 
 
372 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  53.62 
 
 
366 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  51.67 
 
 
363 aa  372  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  52.11 
 
 
374 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  56.8 
 
 
351 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  51.11 
 
 
360 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  51.81 
 
 
360 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  53.14 
 
 
427 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  53.71 
 
 
437 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  53.14 
 
 
427 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  52.86 
 
 
427 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  53.91 
 
 
566 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  53.45 
 
 
360 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  51.1 
 
 
358 aa  362  8e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  49.16 
 
 
358 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  51.14 
 
 
361 aa  360  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  52.45 
 
 
360 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  49.72 
 
 
357 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  52.15 
 
 
356 aa  352  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0019  twitching motility protein  52.11 
 
 
360 aa  352  7e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  50.27 
 
 
358 aa  351  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  51.58 
 
 
344 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  52.82 
 
 
356 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  51.41 
 
 
346 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  54.3 
 
 
369 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  51.18 
 
 
347 aa  350  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  50 
 
 
388 aa  349  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  49.86 
 
 
358 aa  349  4e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  51.7 
 
 
386 aa  349  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  51.86 
 
 
344 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  49.58 
 
 
358 aa  349  4e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  49.43 
 
 
383 aa  348  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  49.72 
 
 
388 aa  348  7e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  51.42 
 
 
387 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  50.28 
 
 
344 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  51 
 
 
344 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  51 
 
 
344 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  48.3 
 
 
387 aa  346  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  53.66 
 
 
372 aa  345  5e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  51.86 
 
 
357 aa  345  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  49.71 
 
 
347 aa  346  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  50.97 
 
 
362 aa  345  6e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  50.29 
 
 
370 aa  345  7e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  51.16 
 
 
346 aa  345  8e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  50.86 
 
 
344 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  49.71 
 
 
347 aa  344  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  51.86 
 
 
344 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  51.65 
 
 
375 aa  344  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  51.86 
 
 
356 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  50.87 
 
 
346 aa  344  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  53.78 
 
 
366 aa  344  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  50.15 
 
 
347 aa  344  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  50.72 
 
 
344 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  50 
 
 
383 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  51.17 
 
 
344 aa  342  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>