More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3256 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  100 
 
 
360 aa  737    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  79.94 
 
 
360 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  69.32 
 
 
372 aa  510  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  58.96 
 
 
367 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  56.21 
 
 
397 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  53.58 
 
 
351 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  54.29 
 
 
360 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  54.13 
 
 
566 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  54.93 
 
 
362 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  52.1 
 
 
382 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  52.44 
 
 
351 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  55.65 
 
 
378 aa  368  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  53.39 
 
 
368 aa  363  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  53.45 
 
 
360 aa  363  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  50.14 
 
 
349 aa  359  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  49.86 
 
 
345 aa  355  5e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  49.72 
 
 
368 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  50.14 
 
 
366 aa  354  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  48.99 
 
 
357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  49.43 
 
 
365 aa  352  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  47.86 
 
 
362 aa  352  4e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  49.86 
 
 
366 aa  352  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  49.43 
 
 
366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  48.45 
 
 
374 aa  352  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  48.41 
 
 
356 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  49.15 
 
 
366 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  49.43 
 
 
366 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  47.26 
 
 
356 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  50.46 
 
 
347 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  49.72 
 
 
365 aa  349  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  48.7 
 
 
356 aa  348  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  53.75 
 
 
339 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  50.29 
 
 
347 aa  346  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  46.11 
 
 
358 aa  346  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  51.01 
 
 
370 aa  345  6e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  51.34 
 
 
358 aa  345  8e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  48.44 
 
 
365 aa  345  8e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  46.69 
 
 
356 aa  345  8e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  47.89 
 
 
375 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  48.42 
 
 
356 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  49.85 
 
 
347 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  51.64 
 
 
344 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  51.08 
 
 
347 aa  344  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  50.75 
 
 
345 aa  343  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  47.92 
 
 
349 aa  343  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  47.92 
 
 
349 aa  343  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4274  twitching motility protein  49.28 
 
 
356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  46.72 
 
 
372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  50.14 
 
 
363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  47.86 
 
 
374 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  50.6 
 
 
348 aa  342  7e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  50.57 
 
 
356 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  48.18 
 
 
362 aa  341  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  49.85 
 
 
347 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  51.04 
 
 
358 aa  340  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  49 
 
 
360 aa  340  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  49.85 
 
 
347 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  48.99 
 
 
350 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  49.27 
 
 
351 aa  340  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  50.9 
 
 
360 aa  340  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  47.37 
 
 
372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  47.46 
 
 
347 aa  339  4e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  49.28 
 
 
350 aa  339  4e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  46.15 
 
 
374 aa  339  5e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  50.15 
 
 
347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  49.14 
 
 
365 aa  338  7e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  49 
 
 
363 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  48.7 
 
 
430 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  51.96 
 
 
347 aa  337  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  50.74 
 
 
358 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  47.29 
 
 
372 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  50.43 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  47.29 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  49.27 
 
 
344 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  49.71 
 
 
344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  50 
 
 
344 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  48.4 
 
 
344 aa  336  5e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  50.15 
 
 
345 aa  335  7e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  48.53 
 
 
372 aa  335  7e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  47.16 
 
 
366 aa  335  7e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  47.28 
 
 
350 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  51.08 
 
 
351 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  48.2 
 
 
365 aa  334  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  48.59 
 
 
358 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1359  twitching mobility protein  48.57 
 
 
371 aa  333  3e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00791421  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  47.8 
 
 
344 aa  333  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  49.85 
 
 
347 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  50 
 
 
346 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  47.11 
 
 
346 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  48.1 
 
 
344 aa  333  4e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  49.24 
 
 
347 aa  332  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1171  twitching motility protein  48.29 
 
 
371 aa  332  5e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000567965  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  50.3 
 
 
344 aa  332  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  49.7 
 
 
344 aa  332  6e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  49.71 
 
 
350 aa  332  8e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2666  twitching motility protein  51.49 
 
 
368 aa  332  9e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  49.55 
 
 
345 aa  331  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  48.05 
 
 
345 aa  331  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  50.15 
 
 
347 aa  331  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  49.71 
 
 
403 aa  331  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>