More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1747 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  100 
 
 
370 aa  771    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  68.19 
 
 
372 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  68.19 
 
 
372 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  66.67 
 
 
372 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  64.71 
 
 
374 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  62.6 
 
 
374 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  63.47 
 
 
372 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  62.91 
 
 
362 aa  474  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  61.06 
 
 
358 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0019  twitching motility protein  59.23 
 
 
360 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  50 
 
 
357 aa  358  7e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  49.42 
 
 
358 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  50.44 
 
 
349 aa  350  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  50 
 
 
347 aa  348  8e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  48.85 
 
 
349 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  49.14 
 
 
368 aa  346  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  48.31 
 
 
360 aa  345  7e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  50.15 
 
 
344 aa  345  8e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  49.57 
 
 
344 aa  345  8e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  49.57 
 
 
344 aa  345  8e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  49.28 
 
 
344 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  49.01 
 
 
397 aa  345  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  49.42 
 
 
344 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  50.58 
 
 
367 aa  344  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  48.71 
 
 
363 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  48.58 
 
 
351 aa  343  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  49.86 
 
 
344 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  49.57 
 
 
344 aa  343  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  49.56 
 
 
347 aa  342  8e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  48.73 
 
 
382 aa  342  9e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  49 
 
 
365 aa  341  9e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  48 
 
 
365 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  48.99 
 
 
344 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  50.57 
 
 
378 aa  341  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  48.57 
 
 
351 aa  341  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  49.01 
 
 
365 aa  339  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  50.29 
 
 
345 aa  339  4e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  48.15 
 
 
366 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  48.7 
 
 
344 aa  338  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  49.01 
 
 
360 aa  338  8e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  47.86 
 
 
366 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  48.42 
 
 
366 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  49.28 
 
 
344 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  47.86 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  50.14 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  48.98 
 
 
345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  49.27 
 
 
345 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  47.85 
 
 
366 aa  335  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  49.16 
 
 
356 aa  335  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  48.52 
 
 
345 aa  335  9e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  48.82 
 
 
345 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  48.82 
 
 
345 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  48 
 
 
347 aa  334  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  48.82 
 
 
345 aa  334  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  46.83 
 
 
365 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  47.83 
 
 
350 aa  333  3e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  48.52 
 
 
345 aa  333  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  48.52 
 
 
345 aa  333  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  47.66 
 
 
349 aa  332  4e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  48.41 
 
 
350 aa  332  6e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  48.52 
 
 
345 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  48.52 
 
 
345 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  48.52 
 
 
345 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  47.99 
 
 
345 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  47.4 
 
 
347 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  48.56 
 
 
347 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  48.52 
 
 
345 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  48.22 
 
 
345 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  47.65 
 
 
566 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  48.82 
 
 
349 aa  330  3e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  48.44 
 
 
347 aa  330  4e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  47.66 
 
 
346 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  48.52 
 
 
344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  47.44 
 
 
360 aa  328  7e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  47.63 
 
 
345 aa  328  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  48.12 
 
 
347 aa  328  8e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  47.97 
 
 
344 aa  328  8e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  48.86 
 
 
362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  47.52 
 
 
347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  47.45 
 
 
347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  47.11 
 
 
347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  47.69 
 
 
350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  47.03 
 
 
360 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  47.97 
 
 
344 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  48.28 
 
 
347 aa  327  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  47.03 
 
 
363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  47.4 
 
 
350 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  50.29 
 
 
358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  49.12 
 
 
344 aa  325  6e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  50 
 
 
356 aa  325  7e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  47.95 
 
 
345 aa  325  9e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  45.35 
 
 
374 aa  325  9e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  46.99 
 
 
372 aa  325  9e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  47.84 
 
 
347 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  47.31 
 
 
347 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  47.31 
 
 
347 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  46.02 
 
 
362 aa  323  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  48.34 
 
 
346 aa  323  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  46.42 
 
 
351 aa  323  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  48.83 
 
 
344 aa  322  6e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>