More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0806 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  93.56 
 
 
363 aa  691    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  100 
 
 
360 aa  739    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  95 
 
 
360 aa  708    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  66.47 
 
 
358 aa  481  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  67.34 
 
 
358 aa  482  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  66.18 
 
 
358 aa  476  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  52.31 
 
 
397 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  55.04 
 
 
367 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  50.72 
 
 
382 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  51.81 
 
 
360 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  51.98 
 
 
360 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  52.74 
 
 
362 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  51.4 
 
 
366 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  51.12 
 
 
366 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  51.12 
 
 
366 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  52.16 
 
 
365 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  51.43 
 
 
349 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  47.86 
 
 
362 aa  362  4e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  49.86 
 
 
375 aa  361  9e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  51.15 
 
 
372 aa  361  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  49.86 
 
 
365 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  47.85 
 
 
388 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  49.28 
 
 
368 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  49.57 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  49.28 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  50.6 
 
 
344 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  49.28 
 
 
365 aa  355  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  48.99 
 
 
363 aa  354  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  51 
 
 
378 aa  354  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  47.8 
 
 
365 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  50.43 
 
 
374 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  48.6 
 
 
365 aa  352  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  49.71 
 
 
388 aa  351  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  48.55 
 
 
387 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  50.58 
 
 
437 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  48.99 
 
 
374 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  49.43 
 
 
351 aa  350  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  50.87 
 
 
427 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  50.29 
 
 
427 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  50.87 
 
 
427 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  49.28 
 
 
368 aa  348  6e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  51.64 
 
 
352 aa  348  8e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  52.8 
 
 
339 aa  347  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  48.55 
 
 
347 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  48.97 
 
 
345 aa  346  4e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1359  twitching mobility protein  47.18 
 
 
371 aa  345  6e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00791421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  47.01 
 
 
366 aa  345  8.999999999999999e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  50.72 
 
 
347 aa  344  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  48.97 
 
 
345 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  48.97 
 
 
345 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  48.68 
 
 
345 aa  344  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  50.59 
 
 
566 aa  344  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  48.97 
 
 
345 aa  344  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  48.97 
 
 
345 aa  343  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  49.71 
 
 
345 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  48.97 
 
 
345 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  48.97 
 
 
345 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  50.9 
 
 
360 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  50.6 
 
 
345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  50.89 
 
 
347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1171  twitching motility protein  46.74 
 
 
371 aa  343  4e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000567965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  49.42 
 
 
387 aa  342  5e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  51.24 
 
 
351 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  48.68 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  48.68 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  48.68 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  49.71 
 
 
386 aa  342  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  49.12 
 
 
347 aa  342  8e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  47.69 
 
 
347 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  47.69 
 
 
347 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  47.69 
 
 
347 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  50.74 
 
 
349 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  50.74 
 
 
349 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  48.09 
 
 
345 aa  340  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  47.8 
 
 
347 aa  340  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  48.02 
 
 
372 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  50.9 
 
 
360 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  48.68 
 
 
349 aa  340  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  49.85 
 
 
357 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  50.91 
 
 
370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1141  Tfp pilus assembly protein pilus retraction ATPase  47.31 
 
 
371 aa  339  4e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000163324  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  47.58 
 
 
358 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  47.11 
 
 
347 aa  339  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  47.06 
 
 
347 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  47.06 
 
 
347 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  48.09 
 
 
347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  48.02 
 
 
374 aa  338  7e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  47.69 
 
 
347 aa  338  8e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  49.55 
 
 
356 aa  338  9e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  48.68 
 
 
345 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  48.39 
 
 
344 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  48 
 
 
351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  47.4 
 
 
383 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  48.24 
 
 
347 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  48.66 
 
 
358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  46.86 
 
 
350 aa  335  7e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  47.95 
 
 
344 aa  335  7e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  50.59 
 
 
345 aa  335  7e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  49.13 
 
 
383 aa  335  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  48.19 
 
 
345 aa  335  7e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>