More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1737 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  98.57 
 
 		 350 aa  701    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  100 
 
 		 350 aa  708    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  60.29 
 
 		 351 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  61.74 
 
 		 349 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  58.21 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  59.3 
 
 		 351 aa  418  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  58.71 
 
 		 360 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  58.55 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  57.91 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  54.04 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  55.97 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  54.73 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  54.65 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  53.89 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  53.43 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  53.87 
 
 		 362 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  51.45 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  55.22 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  51.01 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  52.74 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  53.62 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  51.86 
 
 		 374 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  53.01 
 
 		 347 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  52.21 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  54.85 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  52.29 
 
 		 566 aa  352  5e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  51.33 
 
 		 382 aa  352  7e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  50.74 
 
 		 370 aa  352  7e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  51.18 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  50.59 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  49 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  50.59 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  50.59 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  50.88 
 
 		 345 aa  350  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  50.59 
 
 		 345 aa  348  8e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  50.88 
 
 		 345 aa  348  9e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  50.15 
 
 		 347 aa  347  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  50.6 
 
 		 344 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  50.29 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  51.35 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  50.29 
 
 		 349 aa  347  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  50.88 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  50.59 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  50.59 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  50.59 
 
 		 345 aa  348  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  50.6 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  53.29 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  48.72 
 
 		 366 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  48.72 
 
 		 366 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  48.72 
 
 		 366 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  49.29 
 
 		 365 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  49.86 
 
 		 362 aa  345  7e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  52.84 
 
 		 350 aa  345  7e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  50 
 
 		 345 aa  344  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  51.18 
 
 		 344 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  50.3 
 
 		 344 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  50.58 
 
 		 344 aa  343  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  49.71 
 
 		 363 aa  343  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  49.43 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  50.3 
 
 		 344 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  50.3 
 
 		 346 aa  342  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  51.34 
 
 		 347 aa  342  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  49.27 
 
 		 347 aa  342  5.999999999999999e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  49.42 
 
 		 345 aa  342  7e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  50.15 
 
 		 347 aa  342  8e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  50 
 
 		 346 aa  341  9e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  47.46 
 
 		 358 aa  341  9e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  50 
 
 		 344 aa  340  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  52.6 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  50.15 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  48.72 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  49.7 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  48.99 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  48.72 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  49.86 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  48.69 
 
 		 345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  51.2 
 
 		 349 aa  339  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  51.2 
 
 		 349 aa  339  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  49.1 
 
 		 345 aa  339  5e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  49.12 
 
 		 345 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  50.46 
 
 		 345 aa  338  5.9999999999999996e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  48.42 
 
 		 374 aa  338  5.9999999999999996e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  49.12 
 
 		 344 aa  338  7e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  49.12 
 
 		 344 aa  338  8e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  49.42 
 
 		 347 aa  338  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  49 
 
 		 365 aa  338  9e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  49.71 
 
 		 356 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  49.56 
 
 		 347 aa  337  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  49.7 
 
 		 344 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  48.43 
 
 		 368 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  49.14 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  51.34 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  50.74 
 
 		 347 aa  336  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  49.71 
 
 		 356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  51.04 
 
 		 347 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0097  twitching motility protein  47.7 
 
 		 357 aa  336  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.767539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  51.04 
 
 		 347 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  48.54 
 
 		 345 aa  336  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  48.14 
 
 		 366 aa  335  7e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  49.13 
 
 		 403 aa  335  7.999999999999999e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>