More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_793 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  96.38 
 
 		 363 aa  712    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  95 
 
 		 360 aa  708    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  100 
 
 		 360 aa  740    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  66.86 
 
 		 358 aa  491  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  67.72 
 
 		 358 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  67.15 
 
 		 358 aa  486  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  55.49 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  52.02 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  52.39 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  50.56 
 
 		 365 aa  371  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  52.59 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  52 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  49.57 
 
 		 382 aa  368  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  52.59 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  51.11 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  52.3 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  52.3 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  51.86 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  49.28 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  51.87 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  50 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  47.59 
 
 		 362 aa  363  2e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  49.71 
 
 		 366 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  49.43 
 
 		 366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  49.43 
 
 		 365 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  49.16 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  49.28 
 
 		 363 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  49.57 
 
 		 365 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  49.86 
 
 		 351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  50.6 
 
 		 344 aa  355  5e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1359  twitching mobility protein  48.45 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00791421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  50.43 
 
 		 378 aa  354  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  49.13 
 
 		 387 aa  354  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  50.28 
 
 		 374 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  48.91 
 
 		 427 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  48.91 
 
 		 427 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  47.53 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  47.58 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  48.36 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1171  twitching motility protein  48.17 
 
 		 371 aa  352  4e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000567965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  50 
 
 		 388 aa  352  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  49.28 
 
 		 368 aa  352  5e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  48.36 
 
 		 437 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  48.84 
 
 		 347 aa  350  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  48.56 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  52.42 
 
 		 352 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  51.85 
 
 		 351 aa  349  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  49.71 
 
 		 387 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1141  Tfp pilus assembly protein pilus retraction ATPase  48.19 
 
 		 371 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000163324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  49.71 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  51.86 
 
 		 339 aa  345  5e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  50.72 
 
 		 347 aa  345  6e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  48.27 
 
 		 347 aa  345  6e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  48.27 
 
 		 347 aa  345  6e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  47.83 
 
 		 347 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  49.86 
 
 		 360 aa  345  8e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  48.27 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  47.98 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  48.41 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  47.4 
 
 		 347 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  48.27 
 
 		 383 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  48.84 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  47.09 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  47.09 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  48.55 
 
 		 345 aa  342  4e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  48.84 
 
 		 345 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  48.84 
 
 		 345 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  49.57 
 
 		 345 aa  342  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  49.12 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  47.75 
 
 		 357 aa  342  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  47.95 
 
 		 347 aa  342  5.999999999999999e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  48.84 
 
 		 345 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  48.84 
 
 		 345 aa  342  7e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  48.84 
 
 		 345 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  48.84 
 
 		 345 aa  342  9e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  47.89 
 
 		 372 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  47.69 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  49.42 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  47.58 
 
 		 351 aa  340  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  48.55 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  48.26 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  46.78 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  49 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  48.55 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  48.55 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  48.56 
 
 		 566 aa  340  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  48.01 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  49 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  47.71 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  47.98 
 
 		 347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  47.09 
 
 		 347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  47.21 
 
 		 347 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  48.25 
 
 		 345 aa  338  7e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  48.55 
 
 		 349 aa  338  7e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  48.42 
 
 		 349 aa  338  7e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  48.42 
 
 		 349 aa  338  7e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  47.01 
 
 		 350 aa  338  9e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  48.82 
 
 		 347 aa  337  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  47.98 
 
 		 347 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  50.3 
 
 		 347 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>