More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_06901 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  100 
 
 
357 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  85.51 
 
 
358 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  54.67 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  53.82 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  52.97 
 
 
362 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  52.69 
 
 
374 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  52.69 
 
 
372 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  52.69 
 
 
372 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  52.11 
 
 
358 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  52.42 
 
 
372 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  52.46 
 
 
366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  52.3 
 
 
365 aa  362  6e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  52.46 
 
 
366 aa  361  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  52.3 
 
 
365 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  52.3 
 
 
368 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0019  twitching motility protein  50.71 
 
 
360 aa  358  6e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  50 
 
 
370 aa  358  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  51.01 
 
 
363 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  49.72 
 
 
360 aa  354  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  49.45 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  50.57 
 
 
375 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  52.05 
 
 
362 aa  349  4e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  51.14 
 
 
365 aa  348  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  49.71 
 
 
367 aa  348  9e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  50.86 
 
 
365 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  48.73 
 
 
360 aa  347  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  50.29 
 
 
366 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  50 
 
 
366 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  50.29 
 
 
345 aa  343  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  50 
 
 
366 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  48.83 
 
 
344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  49.71 
 
 
344 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  50.73 
 
 
345 aa  341  9e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  50.73 
 
 
345 aa  341  9e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  50.15 
 
 
345 aa  341  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  50.73 
 
 
345 aa  341  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  50.15 
 
 
345 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  49.85 
 
 
345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  50.44 
 
 
345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  49.56 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  48.99 
 
 
345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  49.57 
 
 
347 aa  339  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  49.85 
 
 
345 aa  339  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  50.14 
 
 
347 aa  339  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  49.42 
 
 
344 aa  338  7e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  49.56 
 
 
345 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  49.56 
 
 
345 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  49.56 
 
 
345 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  49.57 
 
 
347 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  48.99 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  49.86 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  48.08 
 
 
349 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  48.82 
 
 
345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  47.7 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  48.82 
 
 
566 aa  335  5e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  49.27 
 
 
344 aa  335  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  49.27 
 
 
344 aa  335  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  49.27 
 
 
345 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  50.29 
 
 
349 aa  335  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  50.29 
 
 
349 aa  335  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  50 
 
 
344 aa  334  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  49.56 
 
 
349 aa  334  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  49.57 
 
 
347 aa  334  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  52.27 
 
 
344 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  50.9 
 
 
397 aa  334  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  49.12 
 
 
345 aa  333  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  48.67 
 
 
347 aa  333  4e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  47.28 
 
 
382 aa  332  7.000000000000001e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  48.7 
 
 
347 aa  332  7.000000000000001e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  47.71 
 
 
362 aa  332  8e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  48.64 
 
 
370 aa  332  8e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  48.29 
 
 
363 aa  332  9e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  47.71 
 
 
360 aa  332  9e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  49.7 
 
 
356 aa  331  9e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  47.86 
 
 
360 aa  331  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  48.7 
 
 
347 aa  331  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  48.7 
 
 
347 aa  331  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  48.54 
 
 
344 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  49.44 
 
 
356 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  51.2 
 
 
368 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  47.89 
 
 
374 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  50 
 
 
378 aa  330  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  48.25 
 
 
344 aa  329  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  48.7 
 
 
347 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  50.3 
 
 
347 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  49.28 
 
 
347 aa  329  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  48.55 
 
 
346 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  50.3 
 
 
349 aa  328  6e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  50.3 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  48.51 
 
 
349 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  47.84 
 
 
347 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  47.34 
 
 
345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  48.6 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  49.84 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08231  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  50.75 
 
 
347 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.338679  hitchhiker  0.0000605149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  47.79 
 
 
347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  49.4 
 
 
345 aa  325  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  48.06 
 
 
347 aa  325  9e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  48.38 
 
 
352 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  46.97 
 
 
347 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>