More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2594 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  98.09 
 
 		 366 aa  746    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  100 
 
 		 366 aa  754    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  85.67 
 
 		 368 aa  660    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  80.93 
 
 		 363 aa  622  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  80.33 
 
 		 365 aa  617  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  79.67 
 
 		 365 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  78.96 
 
 		 365 aa  608  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  75.07 
 
 		 366 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  74.79 
 
 		 366 aa  591  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  74.79 
 
 		 366 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  74.32 
 
 		 365 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  74.36 
 
 		 374 aa  558  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  65.44 
 
 		 375 aa  514  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  63.74 
 
 		 366 aa  497  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  60.34 
 
 		 362 aa  434  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  56.1 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  54.29 
 
 		 372 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  55.94 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  56.06 
 
 		 378 aa  388  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  54.44 
 
 		 368 aa  391  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  53.14 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  54.44 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  52.97 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  51.1 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  51.1 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  53.63 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  52.57 
 
 		 349 aa  378  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  54.99 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  53.53 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  54.3 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  55.39 
 
 		 566 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  52.99 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  54.01 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  54.3 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  53.96 
 
 		 370 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  54.01 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  54.01 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  54.01 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  52 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  53.41 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  52.02 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  52.77 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  51 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  53.41 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  53.41 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  53.12 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  53.12 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  53.41 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  50.29 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  52.31 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  52.31 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  51.14 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  51.43 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  51.12 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  52.89 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  50.56 
 
 		 374 aa  364  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  52.62 
 
 		 344 aa  363  3e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  53.12 
 
 		 345 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  53.27 
 
 		 344 aa  363  3e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  53.27 
 
 		 344 aa  363  3e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  53.71 
 
 		 344 aa  363  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  52.02 
 
 		 344 aa  363  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  52.52 
 
 		 349 aa  362  4e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  49.43 
 
 		 360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  50.72 
 
 		 351 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  52.42 
 
 		 351 aa  362  8e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  51.3 
 
 		 347 aa  361  9e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  52.46 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  51.3 
 
 		 347 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  52.06 
 
 		 347 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  52.33 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  53.42 
 
 		 344 aa  359  5e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  49.58 
 
 		 358 aa  358  6e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  50.42 
 
 		 403 aa  358  7e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  50.85 
 
 		 430 aa  358  8e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  48.84 
 
 		 347 aa  358  9e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  52.68 
 
 		 345 aa  358  9e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  50.87 
 
 		 344 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  50.87 
 
 		 344 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  49.28 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  51.18 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  50.99 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  50.58 
 
 		 344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  49.13 
 
 		 347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  51.52 
 
 		 349 aa  355  5e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  49.42 
 
 		 344 aa  355  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  50.29 
 
 		 344 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  51.44 
 
 		 437 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  49.13 
 
 		 349 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  49.13 
 
 		 349 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  50.89 
 
 		 345 aa  355  7.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  50.87 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  50.14 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  53.15 
 
 		 339 aa  353  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  49.28 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  52.71 
 
 		 344 aa  353  4e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  50 
 
 		 347 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  50 
 
 		 347 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  50.86 
 
 		 383 aa  352  8e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  50.15 
 
 		 356 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>