More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1321 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  100 
 
 
362 aa  739    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  74.72 
 
 
382 aa  551  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  74.29 
 
 
397 aa  548  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  72.52 
 
 
566 aa  522  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  74 
 
 
378 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  63.71 
 
 
430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  63.51 
 
 
367 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  56.41 
 
 
360 aa  428  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  55.56 
 
 
360 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  57.43 
 
 
372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  56.66 
 
 
366 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  54.42 
 
 
351 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  56.27 
 
 
344 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  55.71 
 
 
365 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  54.19 
 
 
360 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  54.93 
 
 
360 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  54.99 
 
 
366 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  55.56 
 
 
366 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  54.83 
 
 
366 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  55.56 
 
 
366 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  54.62 
 
 
349 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  55.56 
 
 
366 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  52.69 
 
 
365 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  55.43 
 
 
368 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  54.47 
 
 
368 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  54.05 
 
 
349 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  54.05 
 
 
349 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  52.96 
 
 
375 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  54 
 
 
365 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  50.97 
 
 
374 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  55.79 
 
 
351 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  54.71 
 
 
345 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  51.86 
 
 
360 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  52.74 
 
 
360 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  54.12 
 
 
345 aa  381  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  52.3 
 
 
363 aa  380  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  52.86 
 
 
363 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  56.63 
 
 
339 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  53.82 
 
 
349 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  54.12 
 
 
345 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  52.27 
 
 
365 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  53.82 
 
 
345 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  52.31 
 
 
347 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  52.12 
 
 
374 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  54.15 
 
 
350 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  53.87 
 
 
350 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  53.53 
 
 
345 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  53.53 
 
 
345 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  53.53 
 
 
345 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  52.03 
 
 
370 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  51.14 
 
 
349 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  53.24 
 
 
345 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  52.94 
 
 
345 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  53.24 
 
 
345 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  51.16 
 
 
347 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  56.02 
 
 
347 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  53.24 
 
 
345 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  52.31 
 
 
347 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  53.87 
 
 
365 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  53.53 
 
 
345 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  53.24 
 
 
345 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  53.15 
 
 
347 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  50.99 
 
 
374 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  52.89 
 
 
344 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  51.27 
 
 
372 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  53.18 
 
 
347 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  51.57 
 
 
351 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  53.24 
 
 
345 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  54.04 
 
 
347 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  52.89 
 
 
345 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  49.58 
 
 
362 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  53.03 
 
 
356 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  52.02 
 
 
347 aa  368  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  54.04 
 
 
347 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  54.63 
 
 
360 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  52.6 
 
 
347 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  53.01 
 
 
388 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  52.02 
 
 
347 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  52.02 
 
 
344 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  52.74 
 
 
357 aa  364  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  51.92 
 
 
347 aa  364  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  51.73 
 
 
347 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  51.73 
 
 
347 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  53.73 
 
 
360 aa  364  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  51.32 
 
 
358 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  51.8 
 
 
347 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  51.45 
 
 
358 aa  362  6e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  52.31 
 
 
344 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  52.31 
 
 
347 aa  362  6e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  53.11 
 
 
437 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  52.02 
 
 
347 aa  362  8e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  52.31 
 
 
344 aa  361  8e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  51.87 
 
 
356 aa  361  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  51.73 
 
 
347 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  52.31 
 
 
344 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  52.31 
 
 
344 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  52.31 
 
 
344 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  52.2 
 
 
357 aa  360  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  53.31 
 
 
345 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  50.99 
 
 
372 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>