More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1066 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  91.88 
 
 
358 aa  674    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  93.85 
 
 
358 aa  691    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  100 
 
 
358 aa  726    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  66.86 
 
 
360 aa  491  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  66.28 
 
 
363 aa  485  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  66.47 
 
 
360 aa  481  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  55.52 
 
 
349 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  52.56 
 
 
360 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  49.58 
 
 
366 aa  359  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  53.2 
 
 
367 aa  359  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  49.58 
 
 
366 aa  358  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  48.45 
 
 
388 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  49.85 
 
 
397 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  51.14 
 
 
351 aa  352  5e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  52.07 
 
 
372 aa  352  5e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  50.58 
 
 
362 aa  350  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  49.58 
 
 
360 aa  349  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  48.73 
 
 
368 aa  349  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  48.31 
 
 
365 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  48.02 
 
 
365 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  50.86 
 
 
360 aa  345  5e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  51.49 
 
 
339 aa  345  8e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  49.57 
 
 
351 aa  344  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  47.74 
 
 
365 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  47.74 
 
 
366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  47.74 
 
 
366 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  47.46 
 
 
366 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  46.61 
 
 
363 aa  341  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  51.04 
 
 
360 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  49.28 
 
 
347 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  47.58 
 
 
374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  46.48 
 
 
372 aa  339  4e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  50.3 
 
 
566 aa  339  4e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  47.41 
 
 
382 aa  339  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  47.88 
 
 
344 aa  338  7e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  47.03 
 
 
362 aa  338  9e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  47.9 
 
 
375 aa  338  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  47.04 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  49.13 
 
 
427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  49.01 
 
 
374 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  49.13 
 
 
427 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  52.45 
 
 
352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  49.13 
 
 
437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  48.04 
 
 
378 aa  335  5e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  49.13 
 
 
427 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  47.7 
 
 
350 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  47.26 
 
 
369 aa  334  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  45.98 
 
 
365 aa  334  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  47.03 
 
 
368 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  47.26 
 
 
351 aa  333  4e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  49.86 
 
 
350 aa  332  9e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  48.54 
 
 
388 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  47.25 
 
 
370 aa  331  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  45.48 
 
 
365 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  50.31 
 
 
351 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  47.16 
 
 
358 aa  330  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  50.14 
 
 
350 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  46.76 
 
 
386 aa  328  8e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  46.48 
 
 
383 aa  328  8e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  48.53 
 
 
356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  45.66 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  46.2 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  48.07 
 
 
356 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  47.03 
 
 
360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  45.24 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  49.15 
 
 
360 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  45.04 
 
 
360 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  46.99 
 
 
347 aa  323  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  47.84 
 
 
348 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  47.4 
 
 
383 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  45.89 
 
 
357 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  47.09 
 
 
345 aa  322  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  45.64 
 
 
347 aa  322  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1359  twitching mobility protein  45.2 
 
 
371 aa  322  9.000000000000001e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00791421  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  45.93 
 
 
347 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  45.93 
 
 
347 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  46.82 
 
 
383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  46.8 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  47.09 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  47.09 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  47.37 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  48.31 
 
 
358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  47.09 
 
 
345 aa  320  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  47.09 
 
 
345 aa  320  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  45.64 
 
 
347 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  46.82 
 
 
349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  46.82 
 
 
349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1171  twitching motility protein  44.32 
 
 
371 aa  319  6e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000567965  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  45.66 
 
 
347 aa  319  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  45.64 
 
 
347 aa  318  6e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  46.8 
 
 
345 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  46.8 
 
 
345 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  46.8 
 
 
345 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  48.24 
 
 
345 aa  318  7.999999999999999e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  46.24 
 
 
347 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  48.12 
 
 
345 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  47.09 
 
 
345 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  46.63 
 
 
356 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  47.06 
 
 
347 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  47.16 
 
 
360 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>