More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2406 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  100 
 
 		 388 aa  799    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  72.4 
 
 		 386 aa  568  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  71.31 
 
 		 387 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  69.95 
 
 		 383 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  65.33 
 
 		 387 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  68.31 
 
 		 383 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  67.02 
 
 		 383 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  66.93 
 
 		 388 aa  525  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  66.3 
 
 		 427 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  66.58 
 
 		 437 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  65.76 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  65.76 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  59.78 
 
 		 383 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  52.41 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  50.72 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  52.53 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  52.69 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  51.72 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  49.28 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  52.69 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  49 
 
 		 363 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  52.41 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  51.15 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  51.59 
 
 		 365 aa  362  6e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  50.43 
 
 		 363 aa  360  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  51.29 
 
 		 382 aa  359  5e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  47.85 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  48.45 
 
 		 358 aa  357  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  51.28 
 
 		 358 aa  358  9.999999999999999e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  51.88 
 
 		 356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  50.28 
 
 		 365 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  47.91 
 
 		 358 aa  354  2e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  49.17 
 
 		 372 aa  354  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  49.57 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  49.28 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  52.6 
 
 		 351 aa  353  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  47.96 
 
 		 368 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  49.86 
 
 		 375 aa  353  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  53.01 
 
 		 362 aa  352  5e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  47.7 
 
 		 349 aa  352  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  51.01 
 
 		 397 aa  352  8.999999999999999e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  50.56 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  47.91 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  50.44 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  50.14 
 
 		 374 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  52.19 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  52.01 
 
 		 349 aa  349  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  52.01 
 
 		 349 aa  349  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  49.72 
 
 		 360 aa  349  5e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  50.14 
 
 		 351 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  51.16 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  51.62 
 
 		 396 aa  347  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  51.16 
 
 		 345 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  52.51 
 
 		 339 aa  344  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  50.87 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  51.16 
 
 		 349 aa  344  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  50.87 
 
 		 345 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  50.87 
 
 		 345 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  50.87 
 
 		 345 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  50.58 
 
 		 345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  50.58 
 
 		 345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  49.71 
 
 		 362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  52.16 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  50.58 
 
 		 345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  50.29 
 
 		 345 aa  343  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  51.16 
 
 		 345 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  50.57 
 
 		 348 aa  342  5e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  49.14 
 
 		 347 aa  341  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  50.29 
 
 		 345 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  50.42 
 
 		 378 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  50.58 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  49.71 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  48.7 
 
 		 368 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  49.01 
 
 		 358 aa  340  4e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  48.75 
 
 		 372 aa  340  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  50.86 
 
 		 344 aa  339  5e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  51.15 
 
 		 344 aa  339  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  50.57 
 
 		 344 aa  338  7e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  48.61 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  50 
 
 		 347 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  50.29 
 
 		 345 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  49.14 
 
 		 347 aa  336  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  50.57 
 
 		 344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  49.43 
 
 		 347 aa  337  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  48.28 
 
 		 347 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  47.95 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  45.4 
 
 		 351 aa  333  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  47.7 
 
 		 347 aa  333  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  49.14 
 
 		 347 aa  332  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  51.18 
 
 		 362 aa  332  7.000000000000001e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  50.57 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  48.56 
 
 		 347 aa  332  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  48.56 
 
 		 347 aa  332  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  47.97 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  48.56 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  48.56 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  50.43 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  50.31 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  49.14 
 
 		 347 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  44.89 
 
 		 398 aa  330  4e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>