More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3514 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  99.77 
 
 
427 aa  858    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  97.42 
 
 
427 aa  751    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  100 
 
 
427 aa  861    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  94.29 
 
 
437 aa  710    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  67.89 
 
 
387 aa  541  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  68 
 
 
386 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  67.49 
 
 
383 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  65.77 
 
 
387 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  68.27 
 
 
383 aa  524  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  67.73 
 
 
383 aa  522  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  65.85 
 
 
388 aa  518  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  67.03 
 
 
388 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  61.96 
 
 
383 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  51.09 
 
 
372 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  54.02 
 
 
360 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  53.89 
 
 
375 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  53.89 
 
 
356 aa  368  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  52.84 
 
 
360 aa  364  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  53.95 
 
 
358 aa  360  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  53.39 
 
 
366 aa  361  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  50.56 
 
 
351 aa  358  8e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  50.14 
 
 
349 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  51.59 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  52.82 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  51.85 
 
 
358 aa  355  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  51.87 
 
 
366 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  51.87 
 
 
366 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  51.59 
 
 
366 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  50.29 
 
 
351 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  51.14 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  54.46 
 
 
396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  48.91 
 
 
360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  51.16 
 
 
363 aa  351  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  52.31 
 
 
351 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  51.41 
 
 
347 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  50.42 
 
 
366 aa  350  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  49.15 
 
 
365 aa  350  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  51.41 
 
 
366 aa  349  5e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  51.72 
 
 
368 aa  349  5e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  55.16 
 
 
339 aa  349  5e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  50.85 
 
 
368 aa  349  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  50.87 
 
 
360 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  51.44 
 
 
382 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  51.25 
 
 
378 aa  347  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  49.71 
 
 
366 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  49.71 
 
 
366 aa  347  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  51.71 
 
 
366 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  53.08 
 
 
362 aa  346  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  52.4 
 
 
344 aa  345  7e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  48.19 
 
 
358 aa  344  1e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  51.85 
 
 
359 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  48.88 
 
 
358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  50.42 
 
 
365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  48.55 
 
 
375 aa  343  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  50.29 
 
 
374 aa  342  8e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  52.59 
 
 
362 aa  342  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  49.28 
 
 
363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  49.01 
 
 
347 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  50.43 
 
 
370 aa  336  5e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  50 
 
 
362 aa  335  9e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  54.34 
 
 
367 aa  335  9e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  49.13 
 
 
358 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  48.48 
 
 
430 aa  334  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  51.27 
 
 
344 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  48.44 
 
 
347 aa  333  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  49.58 
 
 
347 aa  333  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  48.56 
 
 
349 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  48.56 
 
 
349 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  48.73 
 
 
347 aa  331  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  49.29 
 
 
347 aa  329  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  49.58 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  50.14 
 
 
362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  49.57 
 
 
432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  46.81 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  49.58 
 
 
344 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  46.62 
 
 
403 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  48.54 
 
 
350 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  48.73 
 
 
347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  48.83 
 
 
350 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  48.44 
 
 
345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  48.96 
 
 
348 aa  325  7e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  49.29 
 
 
347 aa  325  7e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  51.23 
 
 
351 aa  325  7e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  49.01 
 
 
347 aa  325  9e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  48.03 
 
 
347 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  49.29 
 
 
344 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  49.01 
 
 
344 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  47.16 
 
 
372 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  49.01 
 
 
344 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  49.3 
 
 
566 aa  324  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  47.86 
 
 
344 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  49.01 
 
 
347 aa  324  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  48.03 
 
 
347 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  46.63 
 
 
356 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  47.18 
 
 
374 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  48.73 
 
 
345 aa  324  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  49.01 
 
 
347 aa  324  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  48.56 
 
 
344 aa  323  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  48.84 
 
 
345 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  49.42 
 
 
350 aa  323  4e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>