More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0889 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  100 
 
 
351 aa  716    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  78.57 
 
 
352 aa  569  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  60.12 
 
 
347 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  58.38 
 
 
344 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  60 
 
 
339 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  53.87 
 
 
351 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  54.3 
 
 
349 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  56.76 
 
 
348 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  56.8 
 
 
360 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  56.4 
 
 
351 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  52.68 
 
 
351 aa  361  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  56.75 
 
 
360 aa  359  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  52.82 
 
 
365 aa  358  8e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  54.85 
 
 
350 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  53.29 
 
 
363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  54.85 
 
 
350 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  53.92 
 
 
356 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  51.85 
 
 
360 aa  349  4e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  48.97 
 
 
350 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  53.94 
 
 
360 aa  345  7e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  51.2 
 
 
360 aa  345  7e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  51.24 
 
 
360 aa  342  5e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  52.25 
 
 
372 aa  342  5.999999999999999e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  51.98 
 
 
397 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  53.85 
 
 
350 aa  338  8e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  50 
 
 
374 aa  338  9e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  51.72 
 
 
368 aa  337  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  51.35 
 
 
375 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  53.63 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  54.04 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  47.8 
 
 
372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  51.1 
 
 
370 aa  334  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  51.4 
 
 
366 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  51.08 
 
 
360 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  51.4 
 
 
366 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  51.4 
 
 
366 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  53.63 
 
 
360 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  50.61 
 
 
360 aa  333  4e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  50.3 
 
 
374 aa  332  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  51.08 
 
 
365 aa  332  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  48.21 
 
 
362 aa  331  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  51.09 
 
 
365 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  50.31 
 
 
388 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  53.92 
 
 
403 aa  330  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  50.31 
 
 
358 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  51.53 
 
 
427 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  49.09 
 
 
372 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  48.49 
 
 
372 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  49.09 
 
 
372 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  51.23 
 
 
363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  50.61 
 
 
358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  51.23 
 
 
427 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  47.11 
 
 
358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  51.51 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  49.4 
 
 
383 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  51.84 
 
 
383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  51.23 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  50.31 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  51.84 
 
 
383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  50.31 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  47.32 
 
 
374 aa  326  3e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  51.55 
 
 
362 aa  326  3e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  50.31 
 
 
368 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  52.09 
 
 
365 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  50.31 
 
 
372 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  48.02 
 
 
358 aa  322  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  49.38 
 
 
358 aa  322  6e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  49.24 
 
 
375 aa  322  9.000000000000001e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  49.23 
 
 
366 aa  321  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  46.73 
 
 
358 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  47.92 
 
 
358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  47.69 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  49.54 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  46.67 
 
 
347 aa  320  3e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  49.21 
 
 
370 aa  320  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  49.85 
 
 
386 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  49.4 
 
 
345 aa  319  5e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  48.34 
 
 
357 aa  319  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  48.92 
 
 
346 aa  318  6e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  47.23 
 
 
347 aa  318  7.999999999999999e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  49.54 
 
 
366 aa  318  9e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  48.62 
 
 
346 aa  317  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  48.92 
 
 
347 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  51.66 
 
 
383 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  49.24 
 
 
345 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  48.32 
 
 
347 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  49.54 
 
 
344 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  47.72 
 
 
357 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1421  twitching motility protein  50 
 
 
360 aa  316  3e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  48.18 
 
 
347 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1467  twitching motility protein  51.19 
 
 
360 aa  317  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  48.18 
 
 
347 aa  316  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  48.92 
 
 
345 aa  316  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  50.62 
 
 
382 aa  315  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  52.81 
 
 
369 aa  315  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  48.16 
 
 
387 aa  315  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  47.43 
 
 
356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  49.26 
 
 
360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  47.31 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  48.92 
 
 
344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>