More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1038 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  100 
 
 		 372 aa  749    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  76.97 
 
 		 369 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  62.29 
 
 		 360 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  62.11 
 
 		 360 aa  457  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  60.57 
 
 		 360 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  58.4 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  54.08 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  55.71 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  56.18 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  55.71 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  54.86 
 
 		 356 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4274  twitching motility protein  56.57 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  54.7 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  54.97 
 
 		 347 aa  378  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  55.36 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  55.79 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  56.1 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  55.65 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  56.4 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  55.79 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  52.57 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  55.79 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  55.79 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  56.7 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  55.49 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  54.68 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  54.38 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  55.79 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  56.1 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  55.79 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  55.79 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  55.79 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  55.46 
 
 		 347 aa  368  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  55.89 
 
 		 344 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  56.1 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  56.83 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  54.22 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  56.39 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  56.39 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  57.45 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  52.8 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  52.84 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  56.39 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  54.87 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  56.07 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  54.52 
 
 		 349 aa  364  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  55.76 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  54.52 
 
 		 349 aa  364  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  56.07 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  56.39 
 
 		 347 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  55.15 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  57.45 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  54.08 
 
 		 347 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  56.07 
 
 		 347 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  52.57 
 
 		 347 aa  361  1e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  54.55 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  55.18 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  55.76 
 
 		 347 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  55.59 
 
 		 344 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  55.59 
 
 		 344 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  54.55 
 
 		 344 aa  359  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  55.9 
 
 		 344 aa  359  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  53.78 
 
 		 344 aa  358  7e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  55.9 
 
 		 344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  49.71 
 
 		 364 aa  355  5e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  53.58 
 
 		 347 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  53.58 
 
 		 347 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  54.21 
 
 		 347 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  51.66 
 
 		 344 aa  355  1e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  53.01 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  53.64 
 
 		 344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  51.36 
 
 		 344 aa  352  5.9999999999999994e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  52.16 
 
 		 356 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  52.15 
 
 		 345 aa  352  5.9999999999999994e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  53.89 
 
 		 347 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  49.55 
 
 		 349 aa  352  7e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  51.13 
 
 		 365 aa  351  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  53.89 
 
 		 347 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  53.01 
 
 		 345 aa  350  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  51.2 
 
 		 344 aa  347  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  51.2 
 
 		 344 aa  347  1e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  52.55 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  53.58 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  53.66 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  51.05 
 
 		 345 aa  345  5e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  54.43 
 
 		 339 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  53.37 
 
 		 346 aa  344  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  51.99 
 
 		 351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  51.04 
 
 		 382 aa  343  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  54.55 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  49.55 
 
 		 351 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  52.13 
 
 		 345 aa  342  8e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  51.35 
 
 		 345 aa  341  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  50.9 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  46.48 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  49.46 
 
 		 378 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  51.17 
 
 		 350 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  51.69 
 
 		 346 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  50.88 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  48.37 
 
 		 351 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>