More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0166 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  100 
 
 
364 aa  750    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  54.93 
 
 
360 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  52.68 
 
 
357 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  52.82 
 
 
356 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  54 
 
 
360 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  52.39 
 
 
360 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  51.4 
 
 
358 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  52.86 
 
 
360 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  51.83 
 
 
356 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  50.87 
 
 
356 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  55.17 
 
 
347 aa  362  6e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  52.01 
 
 
397 aa  362  8e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  51.71 
 
 
356 aa  361  9e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  50.7 
 
 
369 aa  361  9e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  50.56 
 
 
356 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4274  twitching motility protein  52.14 
 
 
356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  49.71 
 
 
372 aa  355  5e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  50.15 
 
 
347 aa  346  4e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  51.16 
 
 
346 aa  345  8.999999999999999e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  49.27 
 
 
347 aa  342  4e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  50.87 
 
 
346 aa  343  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  48.84 
 
 
347 aa  342  5.999999999999999e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  48.84 
 
 
349 aa  342  5.999999999999999e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  49.27 
 
 
347 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  50.44 
 
 
344 aa  339  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  48.69 
 
 
347 aa  338  7e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  48.84 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  50.15 
 
 
344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  49.85 
 
 
347 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  48.68 
 
 
345 aa  336  5e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  50.15 
 
 
344 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  48.68 
 
 
345 aa  334  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  49.55 
 
 
344 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  49.57 
 
 
345 aa  333  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  48.39 
 
 
345 aa  333  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  48.98 
 
 
344 aa  332  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  50.15 
 
 
346 aa  332  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  48.96 
 
 
347 aa  332  8e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  46.94 
 
 
349 aa  332  8e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  47.69 
 
 
347 aa  332  8e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  48.09 
 
 
349 aa  331  9e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  49.25 
 
 
344 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  48.09 
 
 
345 aa  331  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  48.09 
 
 
345 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  49.7 
 
 
345 aa  331  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  48.09 
 
 
345 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  48.09 
 
 
345 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  49.26 
 
 
344 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  48.97 
 
 
345 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  48.68 
 
 
345 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  48.12 
 
 
344 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  47.28 
 
 
566 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  48.81 
 
 
345 aa  330  3e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  48.69 
 
 
344 aa  329  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  50.15 
 
 
344 aa  329  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  47.8 
 
 
345 aa  329  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  47.8 
 
 
345 aa  329  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  47.8 
 
 
345 aa  329  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  47.8 
 
 
345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  47.8 
 
 
345 aa  329  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  48.96 
 
 
347 aa  328  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  48.96 
 
 
347 aa  328  9e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  48.96 
 
 
347 aa  328  9e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  49.55 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  48.96 
 
 
344 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  48.96 
 
 
344 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  48.37 
 
 
347 aa  325  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  47.52 
 
 
344 aa  325  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  48.26 
 
 
345 aa  324  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  47.25 
 
 
349 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  47.48 
 
 
347 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0459  twitching motility protein  46.05 
 
 
364 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0174567  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  49.25 
 
 
360 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  47.25 
 
 
349 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  48.1 
 
 
344 aa  323  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  47.77 
 
 
347 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  47.52 
 
 
345 aa  323  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  48.05 
 
 
347 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  45.14 
 
 
349 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  51.51 
 
 
378 aa  323  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  48.05 
 
 
347 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  48.23 
 
 
372 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  48.37 
 
 
347 aa  322  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  47.96 
 
 
372 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  47.75 
 
 
347 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  49.12 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  48.65 
 
 
347 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  48.05 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  48.54 
 
 
360 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  47.49 
 
 
382 aa  318  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  47.48 
 
 
347 aa  318  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  47.77 
 
 
344 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  47.45 
 
 
347 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  48.05 
 
 
350 aa  317  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  49.27 
 
 
362 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  47.23 
 
 
345 aa  317  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  47.23 
 
 
345 aa  316  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  48.05 
 
 
345 aa  315  9e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  48.17 
 
 
351 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  44.88 
 
 
365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>